结论前置：工资发过后，劳动者依然可以申请劳动仲裁，不仅限于工资支付问题，还包括其他劳动权益纠纷。
一、工资发过后仍可申请劳动仲裁的情形
工资支付问题：
- 支付不足额：即便工资已经发放，但如果实际支付的工资低于劳动合同约定的金额、当地最低工资标准，或者加班工资、绩效奖金、提成等未足额支付，劳动者可以就差额部分申请劳动仲裁。
- 支付不及时：若用人单位未按约定日期支付工资，即使后来补发，劳动者仍可就逾期支付行为申请劳动仲裁，要求支付赔偿金。
其他劳动权益纠纷：
- 劳动关系确认：对于劳动关系的存在与否有争议时，劳动者可以申请仲裁进行确认。
- 合同变更与解除：涉及劳动合同的订立、履行、变更、解除和终止过程中的争议，如经济补偿或赔偿金问题。
- 休息休假与社会保险：关于工作时间、休息休假、社会保险缴纳、福利、培训以及劳动保护等方面的争议。
- 工伤待遇：对于工伤认定及工伤待遇支付存在的争议。
二、申请劳动仲裁的注意事项
仲裁时效：
- 劳动争议申请仲裁的时效期间通常为一年，从当事人知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。超过时效且不存在中断、中止情形的，可能面临败诉风险。
- 对于劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生的争议，劳动者申请仲裁的时效期间不受限制；但劳动关系终止的，应自劳动关系终止之日起一年内提出。
证据收集：
- 劳动者应充分收集并整理相关证据材料，如劳动合同、工资条、银行流水记录、考勤记录、加班通知、工作沟通记录等，以证明自己的主张。证据的充分性和准确性对仲裁结果至关重要。
提交申请书：
- 按照相关规定填写并提交劳动仲裁申请书，详细阐述争议事实、请求事项及理由，并附上相关证据材料。
了解法律法规：
- 熟悉相关的法律法规和程序规定，以便更好地维护自己的合法权益，并在仲裁过程中与用人单位进行有效沟通。
三、具体案例分析
假设劳动者A与用人单位B就工资支付问题存在争议。A认为B未足额支付其加班工资，尽管B已经发放了基本工资，但A仍可以就加班工资的差额部分申请劳动仲裁。在仲裁过程中，A需要提供加班记录、工资条等证据来证明自己的主张。如果仲裁机构认定A的主张成立，B将需要支付A加班工资的差额部分。
四、法律建议
- 及时维权：一旦发现自己的劳动权益受到侵害，劳动者应及时向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以免超过仲裁时效。
- 充分准备：在申请仲裁前，劳动者应充分收集并整理相关证据材料，确保自己的主张有充分的依据。
- 咨询专业律师：虽然我作为何平律师在此提供法律咨询，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，在申请仲裁前或仲裁过程中，劳动者如有需要可以向我进一步咨询，以便更好地维护自己的合法权益。
综上所述，工资发过后并不意味着劳动者不能申请劳动仲裁。只要存在劳动争议，无论是工资支付问题还是其他劳动权益纠纷，劳动者都有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自己的合法权益。