针对您提出的“申请人在申请工伤认定时是否可以变更用人单位”的问题，我们需要从工伤保险的相关规定和实际操作流程来进行分析。
首先，我们要明确的是，工伤认定申请中的用人单位应当是实际承担工伤保险责任、与工伤人员存在劳动关系的单位。在一般情况下，工伤人员发生事故伤害或患职业病时，其所在的用人单位就是申请工伤认定的主体。
然而，在特定情况下，如用人单位发生分立、合并、转让等情形，或者工伤人员同时为多家公司工作且在工伤事故发生时难以明确具体用人单位时，就可能涉及到变更或指定用人单位的问题。
用人单位分立、合并、转让的情况：
- 根据相关规定，如果用人单位因分立、合并、转让等原因安排工伤人员到新用人单位工作的，经三方（原用人单位、新用人单位、工伤人员）协商一致，可以由新用人单位持变更后的劳动合同及情况说明至市社会保险事业管理中心办理工伤保险关系转移手续，承继原用人单位的工伤保险责任。在这种情况下，工伤认定申请中的用人单位可以变更为新用人单位。
工伤人员同时为多家公司工作的情况：
- 如果工伤人员同时为多家公司工作，且在工伤事故发生时难以明确具体用人单位，那么需要依据实际情况和相关证据来判断哪家公司应当承担工伤保险责任。这通常需要通过法律程序（如仲裁、诉讼）来确定劳动关系和用人单位。一旦确定了用人单位，就可以以该单位为申请人进行工伤认定。但在这个过程中，并不涉及“变更”用人单位的问题，而是需要先确定正确的用人单位。
实际操作中的注意事项：
- 在申请工伤认定时，申请人应当提供充分的证据来证明与用人单位之间的劳动关系以及工伤事故的发生情况。
- 如果涉及到用人单位的变更或指定，应当遵循相关法律法规和程序要求，确保变更或指定的合法性和有效性。
- 在任何情况下，都不应当随意变更或指定用人单位以规避工伤保险责任。
综上所述，申请人在申请工伤认定时是否可以变更用人单位取决于具体情况和相关法律法规的规定。在一般情况下，用人单位是固定的；但在特定情况下（如用人单位分立、合并、转让或工伤人员同时为多家公司工作），可能需要根据实际情况和相关证据来判断并变更或指定用人单位。但无论如何变更或指定，都必须遵循相关法律法规和程序要求。