在实习三方协议上，通常建议使用公章进行盖章，但在特定情况下合同专用章也可使用。以下是对此问题的详细分析：

公章的使用

1. 法律效力：公章是公司最高权力的象征，具有最高的法律效力。在实习三方协议上加盖公章，意味着公司对该协议内容的认可和承诺，具有极强的法律约束力。
2. 适用范围：公章适用于公司对外签订的所有重要合同和协议，包括但不限于实习三方协议、劳动合同、采购合同等。
3. 建议：从法律效力和风险防控的角度出发，建议在实习三方协议上加盖公章，以确保协议的法律效力和公司的权益。

合同专用章的使用

1. 法律效力：合同专用章是公司专门用于签订合同的印章，其法律效力仅次于公章。在特定情况下，合同专用章也可以用于签订实习三方协议。
2. 适用范围：合同专用章通常用于公司日常经营活动中签订的各类合同，如销售合同、采购合同等。对于实习三方协议这类特定类型的协议，虽然合同专用章可以使用，但并非首选。
3. 注意事项：如果选择使用合同专用章，应确保该印章的授权范围和使用权限符合公司规定，避免因印章使用不当而引发的法律风险。

实际操作建议

1. 优先使用公章：为了确保实习三方协议的法律效力和公司的权益，建议优先使用公章进行盖章。
2. 明确印章使用规定：公司应制定明确的印章使用规定，明确公章和合同专用章的使用范围、授权程序和使用权限等，以避免因印章使用不当而引发的法律风险。
3. 咨询法律意见：在签订实习三方协议前，建议咨询专业律师的意见，以确保协议内容的合法性和有效性。

可能的法律后果

1. 如果使用公章：一旦协议发生争议，公章的法律效力将得到法院的充分认可，有助于维护公司的权益。
2. 如果使用合同专用章：虽然合同专用章也具有一定的法律效力，但在某些情况下，其法律效力可能不如公章强。如果因此引发争议，公司可能需要承担更多的举证责任和法律风险。

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