合同专用章一般不能用于盖三方协议和实习证明。下面我将从专业角度进行详细解释：

1. 合同专用章的使用范围：

   • 合同专用章，顾名思义，主要是用于签订合同时加盖，以证明合同的真实性和有效性。它通常被用于商业合同、采购合同、销售合同等正式的经济活动中。

2. 三方协议的性质与盖章要求：

   • 三方协议通常涉及三个或更多方的共同意愿和承诺，其法律效力和内容往往比单一的合同更为复杂。因此，三方协议的签订通常需要各方使用各自的公章或合同专用章进行确认，以确保协议的法律效力。然而，这并不意味着合同专用章可以随意用于三方协议，特别是当协议内容超出合同专用章的正常使用范围时。

3. 实习证明的性质与盖章要求：

   • 实习证明是证明个人在某单位实习经历的文件，通常需要由实习单位出具并加盖公章。这种证明文件并不属于经济合同范畴，因此不应使用合同专用章进行盖章。实习证明应使用实习单位正式的公章或人事部门章等具有法律效力的印章。

4. 法律建议：

   • 在使用合同专用章时，应严格遵守其使用范围和规定，避免将其用于不适当的文件或场合。如果需要对三方协议或实习证明进行盖章确认，应咨询相关单位或部门，使用适当的印章以确保文件的法律效力和真实性。

综上所述，合同专用章一般不能用于盖三方协议和实习证明。如有具体法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。