用工单位因员工辞职没有提前告知而扣除三分之二工资的做法，通常是不合理的，但存在特殊情况。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情况下的不合理性
根据《劳动合同法》的相关规定，劳动者辞职应当提前通知用人单位。具体来说，劳动者应提前三十日以书面形式通知用人单位；在试用期内，则需提前三日通知。然而，如果劳动者未按照此规定提前通知就擅自离职，这确实属于违法解除劳动合同的行为，但这并不直接意味着用人单位可以随意扣除劳动者的工资。
在未给用人单位造成实际损失的情况下，用人单位扣除劳动者工资的做法是不合法的。劳动者有权与用人单位进行协商，要求支付被扣除的工资。如果协商不成，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自身的合法权益。
二、特殊情况下的合理性及限制
如果劳动者的擅自离职行为给用人单位造成了实际的经济损失，那么用人单位有权要求劳动者进行赔偿。这种赔偿可以从劳动者的工资中扣除，但扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。例如，如果劳动者突然离职导致用人单位项目进度延误，产生了经济损失，或者因岗位空缺而临时招人产生了额外费用，用人单位在这种情况下有权要求劳动者进行赔偿。
三、具体建议
与用人单位协商：首先，劳动者可以尝试与用人单位进行协商，明确表达自己的诉求，要求支付被扣除的工资。在协商过程中，劳动者可以保留相关的聊天记录、通话录音等证据，以备后续维权之需。
向劳动监察部门投诉：如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉。投诉时，劳动者需要携带能够证明与用人单位存在劳动关系的材料，如劳动合同、工资条、工作证等，以及辞职相关的证明。劳动监察部门会对用人单位进行调查，并责令其支付被扣除的工资。
申请劳动仲裁：劳动者还可以向当地的劳动仲裁机构申请仲裁。在申请仲裁时，劳动者需要准备好仲裁申请书、身份证明、劳动关系证明以及工资扣除的证据等材料。仲裁裁决具有法律效力，如果用人单位不执行仲裁裁决，劳动者可以向法院申请强制执行。
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