在行政案件中，若经鉴定为轻伤二级且当事人明确表示自诉，公安机关的处理方式主要遵循以下原则和流程：

1. 公安机关的初步处理：

   • 轻伤二级已达到刑事立案标准，通常情况下，此类案件应由公安机关进行侦查，并由检察院提起公诉。然而，若当事人明确表示自诉，公安机关在确认当事人自诉意愿真实且合法后，将不再主动介入侦查，而是将案件移交至当事人，由其自行处理。
   • 公安机关在此阶段的主要任务是确保当事人的自诉意愿是自愿、真实且合法的，避免存在胁迫、欺诈等情形。

2. 当事人的自诉准备：

   • 证据收集：作为自诉人，当事人需要自行收集证据，包括但不限于伤情鉴定报告、医疗诊断证明、证人证言、视听资料等。这些证据将用于证明被告人的犯罪行为和造成的损害后果。
   • 提交自诉状：当事人应向有管辖权的法院提交刑事自诉状，详细写明被告人的信息、案由、诉求以及事实理由。自诉状是启动自诉程序的关键文件，必须确保内容真实、准确、完整。

3. 法院的审理流程：

   • 受理与调解：法院在受理自诉案件后，可能会进行庭前调解，试图通过协商解决纠纷。若调解成功，双方可达成和解协议，案件将以此方式结案。
   • 开庭审理：若调解不成，法院将安排开庭审理。在审理过程中，自诉人（即当事人）需要负责举证，证明被告人的犯罪行为和造成的损害后果。证据充分时，被告人将被追究刑事责任。
   • 附带民事诉讼：在刑事自诉过程中，当事人还可以提起附带民事诉讼，要求被告人赔偿经济损失。这有助于当事人全面维护自己的合法权益。

4. 法律后果与判决：

   • 根据《中华人民共和国刑法》第二百三十四条的规定，故意伤害他人身体致轻伤二级的，将面临三年以下有期徒刑、拘役或者管制的处罚。法院在判决时，将综合考虑犯罪动机、手段、影响以及被告人的悔罪表现等因素。
   • 若被告人自愿自首并积极赔偿，取得当事人的谅解，法院可能会酌情从轻或减轻处罚。反之，若被告人拒不认罪或未取得谅解，法院将依法严惩。

针对您的情况，我建议您：

• 确保自诉意愿的真实性和合法性，避免受到任何胁迫或欺诈。
• 积极收集证据，确保能够充分证明被告人的犯罪行为和造成的损害后果。
• 及时向有管辖权的法院提交刑事自诉状，并关注法院的审理流程和要求。
• 在审理过程中，积极配合法院的工作，确保案件能够顺利审理并作出公正判决。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。