在劳务派遣关系中，发生劳动争议时，劳动者申请劳动仲裁可以将用工单位和派遣公司（劳务派遣单位）一起列为被申请人。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十二条的规定：“发生劳动争议的劳动者和用人单位为劳动争议仲裁案件的双方当事人。劳务派遣单位或者用工单位与劳动者发生劳动争议的，劳务派遣单位和用工单位为共同当事人。”这一条款明确指出了在劳务派遣关系中，当发生劳动争议时，劳务派遣单位和用工单位应作为共同当事人参与劳动仲裁。

二、责任主体分析

1. 劳务派遣单位：作为劳动者的用人单位，劳务派遣单位负责与劳动者签订劳动合同，并承担支付劳动报酬、缴纳社会保险等法定责任。若其未履行上述义务，劳动者可直接对其提起劳动仲裁。

2. 用工单位：实际使用派遣劳动者并提供工作场所的单位。若存在同工不同酬、未提供劳动保护条件等违法行为，劳动者同样可将其列为被申请人。

三、具体情形下的被申请人确定

• 一般情况：在劳务派遣关系中，若劳动争议涉及劳务派遣单位和用工单位双方的共同责任，如未签劳动合同、拖欠工资、欠缴社保以及同工不同酬、未提供劳动条件等，劳动者应将两者列为共同被申请人。

• 特殊情况：

  • 若劳动争议仅涉及劳务派遣单位，如劳务派遣单位未按劳动合同约定支付工资、违法解除劳动合同等，劳动者可以单独将劳务派遣单位列为被申请人。
  • 虽然较少见，但在某些情况下，劳动争议可能主要由用工单位的行为导致，且劳务派遣单位对此无责任。例如，用工单位的工作环境存在安全隐患导致劳动者受伤，而劳务派遣单位在派遣过程中并无过错。此时，劳动者可以仅将用工单位列为被申请人。然而，在劳务派遣法律关系中，由于劳务派遣单位和用工单位通常都需对劳动者承担一定责任，因此这种情况相对较少。

四、申请劳动仲裁的注意事项

1. 时效要求：劳动者需在知道权利被侵害之日起一年内提出仲裁申请。

2. 证据准备：劳动者应提交劳动合同、工资流水、考勤记录等材料，以证明劳动关系及权益受损事实。

3. 管辖机构：劳动者应向劳动合同履行地或劳务派遣单位所在地的劳动争议仲裁委员会提出申请。

建议：在实际操作中，劳动者应根据争议的具体情况和相关法律法规准备相应的证据材料，并按照劳动仲裁的程序和要求进行申请。如果你在申请劳动仲裁过程中遇到任何问题，或者需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。