个人与公司合伙开店是合法的，但这一过程中涉及多个法律要点和潜在风险，需要仔细考虑和妥善处理。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、法律基础与合伙协议
法律基础：个人与公司合伙开店，本质上是一种合伙关系，受《中华人民共和国民法典》中关于合伙的规定调整。只要合伙人之间达成一致，并签订合法的合伙协议，明确各方的权利和义务，就具备了法律基础。
合伙协议：合伙协议是合伙关系的基石，必须详细、明确。它应包括各方的出资方式、出资额、利润分配、亏损分担、决策机制、入伙与退伙条件等重要事项。一份完善的合伙协议可以避免日后因约定不明而产生的纠纷。
二、法律责任与风险承担
连带责任：在合伙关系中，合伙人对合伙债务通常承担连带责任。这意味着，如果合伙企业无法清偿债务，债权人可以向任何一个合伙人要求全部债务的清偿。因此，在选择合伙对象时，应充分评估其信用状况和偿债能力。
风险承担：合伙开店意味着共同承担经营风险。个人与公司作为合伙人，应共同面对市场波动、竞争压力等风险。在合伙协议中，应明确风险承担的比例和方式，以避免因风险分配不均而引发的纠纷。
三、工商登记与税务问题
工商登记：合伙开店需要到工商行政管理部门进行登记注册，领取营业执照。这是合伙企业具有合法经营主体资格的必要条件。未进行工商登记的合伙企业，可能面临被取缔、罚款等法律风险。
税务问题：合伙企业应按照法律规定进行纳税申报，缴纳各种税费，如增值税、所得税等。税务合规是合伙企业持续经营的重要保障。个人与公司作为合伙人，应共同关注税务问题，确保合伙企业依法纳税。
四、退出机制与纠纷解决
退出机制：在合伙协议中，应明确合伙人的退出方式和条件。这包括退伙的通知期限、退伙时的财产分配、退伙后对合伙企业债务的承担等。一个明确的退出机制可以避免因合伙人退出而引发的纠纷。
纠纷解决：尽管合伙协议可以尽量避免纠纷，但纠纷仍可能发生。在合伙协议中，可以约定纠纷解决的方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。选择合适的纠纷解决方式，可以高效、公正地解决纠纷，维护合伙人的合法权益。
五、实际操作建议
尽职调查：在选择合伙对象时，应进行充分的尽职调查，了解其信用状况、经营能力、行业经验等。这有助于降低合伙风险，提高合伙成功的概率。
法律咨询：在合伙过程中，如遇到法律问题或纠纷，应及时咨询专业律师。律师可以提供专业的法律意见和解决方案，帮助合伙人维护合法权益。
持续沟通：合伙人之间应保持持续的沟通，及时分享经营信息、市场动态等。这有助于增强合伙人的信任和理解，促进合伙企业的稳定发展。
总结与建议：个人与公司合伙开店是合法的，但需要认真对待各个环节。签订合法有效的合伙协议、遵守法律法规、关注税务问题、明确退出机制和纠纷解决方式等都是保障合伙企业正常运营和合伙人合法权益的重要措施。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。