公司注册后仅用于发工资的行为，其合法性需视具体情况而定，不能一概而论地认为合法或非法。以下从不同角度对此问题进行分析：
合法情形
公司正常运营的一部分：
- 如果公司注册后，虽然主要业务尚未全面展开，但已经开始进行员工招聘、工资发放等前期准备工作，且这些行为符合公司章程和法律法规的规定，那么这种仅用于发工资的行为可以视为公司正常运营的一部分，是合法的。
特定业务模式下的操作：
- 在某些特定业务模式下，如项目制公司或临时性机构，可能存在注册后主要任务就是管理项目资金、发放员工工资等情况。只要这些行为符合相关法律法规和合同约定，且没有损害其他利益主体的合法权益，那么这种行为也是合法的。
非法情形
空壳公司行为：
- 如果公司注册后，没有实际开展任何业务活动，仅用于发放工资或进行其他非法资金流转，如洗钱、逃税等，那么这种行为就构成了空壳公司行为，是违法的。空壳公司不仅违反了公司法等相关法律法规，还可能涉及刑事犯罪。
违反劳动法规：
- 即使公司注册后用于发放工资，但如果工资发放过程中存在违反劳动法规的行为，如拖欠工资、未依法缴纳社会保险费等，那么这种行为也是违法的。公司需要承担相应的法律责任，包括补发工资、缴纳社会保险费、支付赔偿金等。
税务违规：
- 如果公司注册后仅用于发放工资，但未依法进行税务登记和纳税申报，或者存在偷税、漏税等税务违规行为，那么这种行为也是违法的。税务机关将依法对公司进行税务处罚，包括补缴税款、加收滞纳金、处以罚款等。
法律建议
确保公司正常运营：
- 公司注册后，应尽快开展实际业务活动，确保公司正常运营。如果暂时无法开展业务，也应按照公司章程和法律法规的规定进行资金管理和员工工资发放。
遵守劳动法规：
- 在工资发放过程中，应严格遵守劳动法规的规定，确保工资按时足额发放，并依法缴纳社会保险费。同时，应建立健全的工资管理制度和员工档案管理制度，以备查验。
依法进行税务登记和纳税申报：
- 公司注册后，应依法进行税务登记和纳税申报。在工资发放过程中，应依法代扣代缴个人所得税等税费，并按时向税务机关报送相关税务资料。
寻求专业法律意见：
- 如果对公司注册后仅用于发工资的行为存在疑问或担忧，建议及时寻求专业法律意见。律师可以根据公司的具体情况和法律法规的规定，为公司提供合法合规的建议和指导。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况和法律法规的规定，为您提供专业、全面的法律服务。