劳动合同中违纪解除劳动关系的条款，在符合法定条件的情况下，是有效的。以下是对此问题的详细分析：
一、条款内容合法合规是前提
劳动合同中的违纪解除条款，其内容必须合法合规，不得违反国家法律、行政法规的强制性规定。例如，合同中不能规定侵犯女职工合法生育权的条款，如“女性员工入职后三年内不得生育，否则视为严重违纪予以辞退”，此类条款因违法而无效，公司不能据此解除合同。
二、规章制度民主公示是基础
虽然劳动合同中可以约定违纪解除条款，但这里的“规章制度”背景或引用基础必须具备法律效力。根据《劳动合同法》的相关规定，涉及劳动者切身利益的规章制度必须经过民主程序制定，并向劳动者公示告知。如果公司规章制度未履行上述程序，即使合同中有引用，该制度也不能作为解雇的有效依据。不过，若劳动合同本身已经通过平等自愿、协商一致的原则订立，且内容合法，那么它本身就可以视为双方对违纪行为及处理方式的约定，无需额外依赖规章制度的民主公示程序（但实践中，完善的规章制度仍是企业管理的重要基础）。
三、事实清楚、证据确凿是关键
公司在依据劳动合同中的违纪解除条款解除劳动关系时，必须有充分证据证明员工确实存在合同中规定的违纪行为。例如，旷工应有考勤记录，严重失职应有造成重大损失的证明等。没有确凿证据，公司不能随意解除劳动关系。
四、程序正当不可忽视
在做出解除决定前，公司应履行告知、调查甚至听取申辩等程序，并将解除决定书面送达员工。这是保障员工权益的重要环节，也是避免法律纠纷的关键步骤。
五、实际操作中的注意事项
举例说明：
假设某公司与员工在劳动合同中约定：“员工连续旷工三天，公司有权解除劳动合同。”后来，该员工确实连续旷工三天，且公司有充分的考勤记录作为证据。同时，公司在做出解除决定前，已经履行了告知、调查等程序，并将解除决定书面送达了员工。在这种情况下，公司依据劳动合同中的违纪解除条款解除劳动关系，是合法的。
总结与建议：
劳动合同中的违纪解除条款在符合法定条件的情况下是有效的。但企业在行使这一权利时，必须确保内容合法、程序民主、证据充分、操作合规。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。