在未取得施工许可证擅自施工的案件中，认定一般责任人主要依据相关法律法规以及具体案件的事实情况。以下是对此问题的详细解答：
一、法律法规依据
《中华人民共和国建筑法》第六十四条：
- 违反本法规定，未取得施工许可证或者开工报告未经批准擅自施工的，责令改正，对不符合开工条件的责令停止施工，可以处以罚款。
《建设工程质量管理条例》第五十七条：
- 违反本条例规定，建设单位未取得施工许可证或者开工报告未经批准，擅自施工的，责令停止施工，限期改正，处工程合同价款百分之一以上百分之二以下的罚款。
二、责任人认定
在未取得施工许可证擅自施工的案件中，一般责任人主要包括建设单位和施工单位，具体责任划分如下：
建设单位责任：
- 建设单位作为项目的发起者和组织者，有责任在施工前办理施工许可证。如果建设单位未办理施工许可证而擅自施工，将承担主要责任。
- 建设单位需要提供相应的材料以配合施工单位办理施工许可证，如果因建设单位原因导致无法办理或延误办理，建设单位应承担相应责任。
施工单位责任：
- 施工单位作为实际施工者，有义务在施工前确认施工许可证的办理情况。如果施工单位在明知未取得施工许可证的情况下擅自施工，也将承担一定责任。
- 施工单位应配合建设单位办理施工许可证，如果因施工单位原因导致无法办理或延误办理，施工单位也应承担相应责任。不过，在多数情况下，施工单位的责任相对较轻，除非其存在故意隐瞒或协助建设单位规避监管的行为。
三、责任认定流程
立案：
- 发现未取得施工许可证擅自施工的违法行为后，相关部门将予以审查，并决定是否立案。
调查：
- 指定专人负责调查取证，与当事人有直接利害关系的应当回避。执法人员不得少于两人，调查时应出示证件，允许当事人辩解。
审查：
- 审理案件调查报告，对案件违法事实、证据、调查取证程序、法律适用、处罚种类和幅度、当事人陈述和申辩理由等方面进行审查，提出处理意见。
告知与决定：
- 作出行政处罚决定前，应制作《行政处罚告知书》送达当事人。符合听证规定的，还应制作并送达《行政处罚听证告知书》。
- 作出处罚决定后，制作《行政处罚决定书》，并载明行政处罚告知、当事人陈述申辩或者听证情况等内容。
送达与执行：
- 按法律规定的方式和期限，将《行政处罚决定书》送达当事人。
- 依照生效的行政处罚决定执行处罚。
四、注意事项
- 在认定责任人时，应充分考虑案件的具体事实情况，包括建设单位和施工单位在施工许可证办理过程中的行为表现、过错程度等。
- 对于不履行或不正确履行行政职责的行政机关及其工作人员，也将依据相关法律法规追究相应的责任。
综上所述，在未取得施工许可证擅自施工的案件中，一般责任人主要包括建设单位和施工单位，具体责任划分需依据相关法律法规和案件事实情况来确定。