结论前置：在因上班途中车祸造成工伤且自身占50%责任的情况下，保险公司是否赔付需分情况讨论，具体如下：

1. 若涉及交通事故责任强制保险（交强险）：
   根据《机动车交通事故责任强制保险条例》，交强险的赔付不区分责任比例，只要被保险机动车在道路交通事故中有责任（无论全责、主责、同责还是次责），保险公司均需在交强险责任限额内赔付。因此，即使您承担50%责任，交强险仍会赔付，但赔付范围仅限于对方（第三者）的人身伤亡和财产损失，不包含您自身的损失。

2. 若涉及商业车险（如车损险、座位险等）：

   • 车损险：赔付您自身车辆的损失，但需按责任比例划分。若您承担50%责任，保险公司通常仅赔付您车辆损失的50%，剩余50%需由对方车辆赔付（或通过对方交强险/商业险赔付）。
     
   • 座位险（车上人员责任险）：赔付您自身因事故导致的人身伤亡费用，同样按责任比例赔付。若您承担50%责任，座位险可能仅赔付50%的医疗费用等，但具体需以保险合同条款为准。
     
   • 意外险（如个人综合意外险）：若您购买了个人意外险，且事故符合保险条款（如“非本人故意”），通常可获得全额赔付，不区分责任比例。但需注意，部分意外险可能将“机动车交通事故”列为免责范围，需仔细阅读合同。

3. 工伤与保险赔付的关系：

   • 您已从公司获得工伤工资（即停工留薪期工资），这属于工伤保险待遇的一部分。根据《工伤保险条例》，工伤保险与交通事故赔偿可“双赔”，但需注意：
     
     • 医疗费用：若已通过交通事故方或其保险公司获得赔付，工伤保险不再重复赔付；
       
     • 伤残补助金：若交通事故导致伤残，可同时获得工伤保险的伤残补助金和交通事故的伤残赔偿金（两者标准不同，不冲突）；
       
     • 误工费：工伤工资与交通事故的误工费可能存在重叠，需根据实际损失和赔付情况调整。
       
   • 保险公司赔付时，可能要求您提供工伤认定证明，以确认事故性质和赔付范围。

建议：

• 尽快联系保险公司报案，并提交事故认定书、工伤认定书等材料；
  
• 仔细核对保险合同条款，尤其是免责条款和赔付比例；
  
• 若对赔付金额有异议，可要求保险公司出具详细赔付计算书，或通过法律途径维权。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合具体案情为您详细分析。