结论：公司扣除你1000元培训费是否合理，需根据劳动合同及公司规章制度的具体内容，以及是否符合相关法律法规来判断。
分析：
劳动合同及公司规章制度：
- 首先，要查看你与公司签订的劳动合同中是否有关于培训费用的约定。如果合同中明确规定了员工需承担培训费用，或在违反规定时需承担相应责任，且这些规定是合理合法的，那么公司扣除培训费可能有一定的依据。
- 其次，要审查公司的规章制度。如果规章制度中明确规定了培训费用的承担方式，以及员工在离职时需承担的费用，且这些规定已经过民主程序制定并公示，那么公司扣除培训费也可能是合理的。
法律法规：
- 根据《劳动合同法》第二十二条，用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与劳动者订立协议，约定服务期。劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。但违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用，且用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
- 这意味着，如果公司为你提供了专项培训，并约定了服务期，而你在服务期内离职，那么公司有权要求你支付违约金，但违约金的数额应受到上述限制。
- 同时，根据《劳动合同法实施条例》第二十六条，如果劳动者是依照劳动合同法第三十八条的规定解除劳动合同的（如用人单位未提供劳动保护或劳动条件、未及时足额支付劳动报酬等），则不属于违反服务期的约定，用人单位不得要求劳动者支付违约金。
具体情况分析：
- 如果你与公司签订的劳动合同或公司规章制度中没有关于培训费用的明确约定，或者约定不合理，那么公司扣除你1000元培训费可能是不合理的。
- 如果你在服务期内离职，但公司要求的违约金超过了其提供的培训费用或服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用，那么公司扣除的培训费也是不合理的。
- 如果你离职是因为公司存在违法行为（如未提供劳动保护或劳动条件、未及时足额支付劳动报酬等），那么你解除劳动合同不属于违反服务期的约定，公司不得要求你支付违约金。
建议：
- 你可以先与公司进行沟通，了解扣除培训费的具体依据和计算方式。
- 如果沟通无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
- 在处理此类纠纷时，建议保留好相关证据（如劳动合同、公司规章制度、培训费用发票等），以便在需要时提供证明。
后续行动：
- 如果你需要进一步的法律帮助或咨询，可以直接向我提问，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。