在行政诉讼中发现刑事案件时，行政诉讼能否继续，需根据具体情况判断，一般而言，行政诉讼可能中止，也可能继续进行。以下是对此问题的详细分析：
一、行政诉讼可能中止的情形
刑事案件处理结果对行政诉讼有决定性影响：
- 当行政诉讼案件中的被告存在其他犯罪事实，且这些犯罪事实与行政案件具有关联性时，若公安司法机关对有关犯罪事实的处理结果会影响行政诉讼案件的判决结果，此时应当裁定中止行政诉讼。
- 操作流程：中止期间，法院会将犯罪情况或线索及时移送侦查机关，并等待刑事案件审结后，依据刑事案件的认定结果继续审理行政诉讼案件。例如，若行政诉讼涉及的是某行政机关对某企业的处罚决定，而该处罚决定背后隐藏着企业负责人的刑事犯罪行为（如贪污、受贿等），且该犯罪行为与处罚决定的合法性紧密相关，那么行政诉讼就应当中止，等待刑事案件的审结。
行政行为本身涉嫌刑事犯罪：
- 若行政行为本身涉嫌刑事犯罪，如贪污受贿、滥用职权等，且这些犯罪行为与行政诉讼案件紧密相关，那么行政诉讼也应当中止，以便刑事案件的优先处理。
- 法律依据：根据《行政诉讼法》及相关司法解释的规定，当行政案件的审理依赖于刑事案件的审理结果时，应遵循“先刑后行”原则。
二、行政诉讼可能继续进行的情形
刑事犯罪与行政诉讼关联不大：
- 若刑事犯罪与行政诉讼关联不大，或刑事案件的处理结果不会对行政诉讼产生实质性影响，法院在移送刑事案件后，可继续进行行政诉讼的审理。
- 操作流程：法院应依据已有的证据和相关法律规定，对行政行为的合法性等核心问题进行独立判断并作出裁判。例如，若行政诉讼涉及的是某行政机关对某公民的行政处罚决定，而该处罚决定背后并未隐藏任何刑事犯罪行为，或者即使存在刑事犯罪行为，但该行为与处罚决定的合法性无关，那么行政诉讼就可以继续进行。
刑事自诉案件且当事人未控诉被告：
- 对于刑事自诉案件，若当事人没有控诉被告，法院可继续审理行政诉讼请求。
- 特殊情况处理：若原告希望追究被告人的刑事责任并提出相应诉讼请求，法院可将行政案件中的相关部分移送刑事庭进行审理。
三、实践中的考量因素与注意事项
案件复杂程度与周期：
- 考虑刑事案件的侦查和审理周期，避免长时间中止行政诉讼对当事人合法权益的影响。法院可在不影响刑事案件处理的前提下，对行政诉讼案件中可独立判断的部分先行审理。
当事人权益保护：
- 确保当事人在刑事案件审理过程中的知情权和参与权，避免因刑事案件处理而使行政诉讼当事人的权益受到不合理损害。
案件材料移送与沟通协调：
- 法院在移送刑事案件时，应提供完整的案件材料、证据及行政处理决定，以支持侦查机关的刑事侦查工作。同时，加强与侦查机关、检察机关的沟通协调，确保案件处理的连贯性和一致性。
建议：在行政诉讼过程中发现刑事案件时，当事人应及时与法院沟通，了解案件的具体情况和处理方式。同时，当事人也可以咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。如果有任何行政诉讼或刑事辩护方面的疑问，可以直接向我咨询。