协商解除劳动合同的经济补偿金一般不包括年休假未休工资，二者可分别主张。以下从不同角度为您详细分析：

一、经济补偿金与未休年假工资的性质

1. 经济补偿金：是用人单位与劳动者协商一致解除劳动合同，或者用人单位依照法律规定解除劳动合同时，按照劳动者在本单位的工作年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付的补偿。其计算依据主要是劳动者的工作年限和平均工资。

2. 未休年假工资：是劳动者因未享受年休假而应获得的额外报酬，是对劳动者休息休假权益未得到保障的一种补偿。其计算依据主要是劳动者未休的年假天数和日工资收入。

二、经济补偿金与未休年假工资是否可同时主张

经济补偿金与未休年假工资是两种性质不同的补偿，可以分别主张。在协商解除劳动合同时，如果劳动者存在未休年假的情形，除了可以主张经济补偿金外，还可以另行主张未休年假工资。用人单位应当依法分别支付这两项费用。

三、法律依据与实务操作

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，经济补偿金是用人单位与劳动者解除或终止劳动合同时应支付的补偿。
   • 而未休年假工资则依据《职工带薪年休假条例》等相关规定，劳动者享有带薪年休假的权利，未休年假应获得相应补偿。

2. 实务操作：

   • 在协商解除劳动合同时，双方应明确经济补偿金的金额和支付方式。
   • 同时，劳动者应关注自己未休年假的情况，并有权要求用人单位支付未休年假工资。
   • 如果用人单位拒绝支付未休年假工资，劳动者可以通过劳动仲裁等法律途径维护自己的合法权益。

四、特殊情况下的处理

如果用人单位与劳动者在协商解除劳动合同时，已经就未休年假工资进行了协商并达成了一致意见（例如将未休年假工资折算入经济补偿金中），那么在这种情况下，经济补偿金可能包含了未休年假工资的部分或全部。但这种情况需要双方有明确的约定，并且该约定不违反法律法规的强制性规定。

建议：在协商解除劳动合同时，劳动者应仔细阅读合同条款，确保自己的权益得到充分保障。如果对经济补偿金或未休年假工资有疑问，可以及时向用人单位提出，并要求其进行明确说明。如有需要，也可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律意见。