实习生因不在岗被教育局查岗发现，可能面临的处罚需结合具体情形及单位规章制度综合判断，一般包括以下几种情况：

1. 内部纪律处分
   若实习生与用人单位（如学校）存在明确的实习协议或内部管理规定，且协议中约定了“擅自离岗属于违纪行为”，则用人单位可依据内部制度给予警告、通报批评、扣减实习补贴、缩短实习期限或终止实习等处分。
   法律依据：根据《劳动合同法》第九十条（虽实习生不适用劳动关系，但单位规章制度可参照适用），劳动者违反规章制度给单位造成损失的，单位可要求赔偿；实习关系中，单位亦可依据协议约定行使管理权。

2. 影响实习评价与证明
   教育局查岗记录可能作为实习考核的依据。若实习生多次不在岗，用人单位可能在其实习鉴定中给予“不合格”评价，或拒绝出具实习证明，直接影响其未来求职或学业认证（如毕业要求）。

3. 民事责任风险
   若因实习生不在岗导致教学事故、学生安全事件等损失，用人单位可能依据《民法典》第一千一百九十一条（劳务关系中提供劳务方致损的责任）要求实习生或其监护人承担部分赔偿责任（尤其针对未成年实习生）。

4. 行政或行业处罚（极少数情形）
   若实习生行为涉及违法（如伪造考勤记录、利用职务之便谋利），可能面临行政处罚；若在教育行业造成恶劣影响，教育局或行业协会可能将其列入“不诚信实习人员名单”，影响后续从业资格。

建议：

• 实习生应严格遵守实习协议中的考勤制度，确需请假时按流程报备；
  
• 用人单位应在协议中明确违纪后果，并保留查岗记录、沟通记录等证据；
  
• 若已发生纠纷，可依据协议条款协商解决，或通过教育主管部门调解。
  

如有具体案例或协议条款需分析，可进一步提供细节，我将结合证据材料给出针对性建议。