针对您提出的“违规中标的项目如何处罚，尤其是工程已经完成的情况”，以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，所有涉及违反相关法规的获选程序都将导致所授标的项目失去有效性，这一点不受工程是否完成的影响。也就是说，即便工程已经完工，如果发现中标过程存在违规行为，该项目仍然会被视为无效。

接下来，我们具体看看违规中标可能面临的处罚措施：

1. 罚款：

   • 若发现涉嫌投标者之间或与招标机构勾结作弊的情况，根据违规的严重程度，将对涉事单位施加相当于中标项目金额的0.5%至1%的罚款。
   • 同时，对于该单位内部负主要责任的主管领导者以及直接参与此类行为的具体实施者，也将分别处以单位罚款数额的5%到10%作为个人罚款。

2. 没收违法收益：

   • 若在违规中标过程中存在相应的非法所得，相关部门将对此收益进行彻底清除，即没收违法所得。

3. 取消投标资格：

   • 在严重情况下，对涉事单位将采取撤销其一年乃至两年内参与所有法定需要通过招标来完成的项目的投标资格的措施，并公开进行公示通知。

4. 吊销营业执照：

   • 尽管这并不常见，但在极端违规的情况下，工商行政机关有权吊销涉事单位的商业执照，以示惩戒。

5. 刑事责任追究：

   • 一旦违规行为被确认为犯罪行为，将依照法律规定追究涉事单位和个人的刑事责任。

6. 赔偿责任：

   • 如因违规行为对他人造成了实质性的损害，涉事单位和个人也将按照法律规定承担相应的赔偿责任。

特别需要注意的是，根据《中华人民共和国招标投标法》第五十三条的规定，投标人相互串通投标或者与招标人串通投标的，以及投标人以向招标人或者评标委员会成员行贿的手段谋取中标的，中标均无效，并会面临上述的罚款、没收违法所得、取消投标资格、吊销营业执照以及刑事责任追究等处罚。

因此，即使工程已经完成，如果发现中标过程存在违规行为，相关部门仍然会依法进行处罚。这强调了合规投标的重要性，以及违规行为可能带来的严重后果。希望这个解答能够帮助您更好地理解违规中标项目的处罚措施。