非法中标已施工的情况下，处罚措施主要依据相关法律法规对违法行为进行认定，并据此给予相应的行政处罚、民事赔偿以及可能的刑事责任追究。以下从不同角度详细分析：
一、行政处罚
对中标人的处罚：
- 根据《中华人民共和国招标投标法》第五十三条，如果中标人存在违法行为，如相互串通投标或者与招标人串通投标，或者以向招标人或者评标委员会成员行贿的手段谋取中标等，中标将无效。
- 处罚措施包括：处中标项目金额千分之五以上千分之十以下的罚款，对单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员处单位罚款数额百分之五以上百分之十以下的罚款；有违法所得的，并处没收违法所得；情节严重的，取消其一年至二年内参加依法必须进行招标的项目的投标资格并予以公告，直至由工商行政管理机关吊销营业执照。
对招标人的处罚：
- 如果招标人在招标过程中存在违法行为，如依法必须进行招标的项目，招标人违反本法规定，与投标人就投标价格、投标方案等实质性内容进行谈判的，或者泄露应当保密的与招标投标活动有关的情况和资料的等，同样会受到行政处罚。
- 处罚措施包括：给予警告，对单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予处分；影响中标结果的，中标无效。
二、民事赔偿
- 赔偿损失：因非法中标导致其他投标人或招标人遭受损失的，中标人应承担赔偿责任。这包括直接经济损失和间接经济损失，如因非法中标导致的合同无法履行、工期延误等产生的额外费用。
三、刑事责任追究
- 串通投标罪：如果非法中标行为构成串通投标罪，根据《中华人民共和国刑法》第二百二十三条，投标人相互串通投标报价，损害招标人或者其他投标人利益，情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
- 行贿罪：如果中标人通过行贿手段谋取中标，还可能构成行贿罪，根据行贿的数额和情节轻重，将受到相应的刑事处罚。
四、实际案例与法律适用
- 在实际案例中，法院会根据具体事实和证据，结合相关法律法规，对非法中标行为进行认定，并据此作出判决。例如，如果中标人通过串通投标或行贿手段获得中标，且该行为被查实，法院可能会判决中标无效，并要求中标人承担行政处罚、民事赔偿以及可能的刑事责任。
五、建议与措施
- 加强监管：招标人应加强对招标过程的监管，确保招标活动的公开、公平、公正，防止非法中标行为的发生。
- 完善制度：建立健全招标投标制度，明确各方责任和义务，规范招标投标行为。
- 及时维权：如果发现非法中标行为，其他投标人或招标人应及时向相关部门举报，并寻求法律援助，维护自身合法权益。
综上所述，非法中标已施工的情况下，中标人将面临行政处罚、民事赔偿以及可能的刑事责任追究。因此，建议各方在招标投标过程中严格遵守相关法律法规，确保招标活动的合法性和公正性。如果您在建设工程领域遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询。