与招标人串通投标且工程已经完工的，相关责任主体仍会受到法律的严厉处罚。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

一、处罚依据

根据《中华人民共和国招标投标法》第五十三条的规定，投标人相互串通投标或者与招标人串通投标的，中标无效，并会面临一系列严厉的处罚措施。这些措施包括但不限于罚款、取消投标资格、吊销营业执照，以及在构成犯罪时依法追究刑事责任。

二、具体处罚措施

1. 行政处罚：

   • 罚款：对参与串标的单位和个人，将处以中标项目金额千分之五以上千分之十以下的罚款。同时，对单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员，也会处以单位罚款数额百分之五以上百分之十以下的罚款。
   • 取消投标资格：对于情节严重的串标行为，相关责任主体将被取消一年至二年内参加依法必须进行招标的项目的投标资格，并予以公告。
   • 吊销营业执照：对于构成严重违法的企业，可能面临吊销营业执照的处罚，这将直接影响企业的正常运营。

2. 刑事责任：

   • 如果串标行为构成犯罪，如串通投标罪等，相关责任人员将依法承担刑事责任，可能面临有期徒刑、拘役和罚金等刑罚。

3. 民事赔偿：

   • 串标行为给其他投标人或招标人造成损失的，应依法承担赔偿责任。这包括赔偿因串标行为导致的直接经济损失和间接经济损失。

4. 其他处罚：

   • 对于存在串标行为的招标代理机构，可能会面临暂停直至取消招标代理资格的处罚。
   • 相关不良行为记录将被记入信用档案，并向社会公布，这将影响企业的信誉和未来的招投标活动。

三、处罚程序

1. 立案调查：相关监管部门在发现串标行为后，会进行立案调查，收集证据，查明事实。
2. 作出处罚决定：根据调查结果，监管部门会依法作出处罚决定，明确处罚种类、幅度和期限等。
3. 执行处罚：被处罚的单位和个人应按照处罚决定的要求，按时缴纳罚款，履行其他处罚义务。
4. 申诉与复议：被处罚的单位和个人如对处罚决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。

四、实际案例与法律后果

在实际操作中，串标行为一旦被发现，无论工程是否已经完工，相关责任主体都将面临法律的严厉制裁。例如，某企业因与招标人串通投标被查处，不仅被处以巨额罚款，还被取消了未来两年的投标资格，同时企业信誉也受到了严重影响，导致后续业务开展受阻。

总结与建议：

与招标人串通投标是严重的违法行为，不仅违反了市场竞争的公平原则，也损害了其他投标人的合法权益。因此，我建议各企业在参与招投标活动时，务必遵守相关法律法规，诚信经营，避免陷入法律风险。如果面临相关法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我将竭诚为您提供专业的法律服务。