结论：生产企业已停用的包材是否违法以及是否可以不没收，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下分情况说明：

1. 若包材本身合法，仅因停用而不没收
   如果包材本身符合法律法规要求（如标签、标识、成分等均合法），仅因企业停用而闲置，则不存在违法情形，自然无需没收。例如，企业因产品升级更换包装，原包材未使用但未过期、未变质，且无其他违法行为，监管部门通常不会没收。

2. 若包材违法，是否没收需结合违法性质

   • 轻微违法（如标签瑕疵）：若包材存在轻微违法（如标签未标注生产日期，但产品本身合格），监管部门可能责令整改（如补标），而非直接没收。
     
   • 严重违法（如假冒、伪劣、禁用物质）：若包材涉及假冒注册商标、伪劣产品、使用禁用物质（如有毒有害原料），或包材本身属于非法生产（如无生产许可证），则属于严重违法行为，监管部门有权没收违法包材，并可能处罚企业。
     
   • 主观故意与情节轻重：若企业明知包材违法仍使用或停用后未妥善处理（如流入市场），可能被认定为情节严重，加重处罚；若企业主动报告并配合处理，可能从轻或免于没收。

3. 法律依据与程序要求
   根据《行政处罚法》《产品质量法》等规定，没收违法物品需满足“违法事实成立”且“物品与违法行为直接相关”等条件。监管部门需依法调查取证，出具处罚决定书，并告知企业救济途径（如复议、诉讼）。企业若认为没收决定违法，可通过法律程序维权。

建议：

• 企业应定期自查包材合法性，停用后妥善处理（如销毁、返厂），避免闲置包材被用于非法用途。
  
• 若面临监管调查，积极配合并提供证据（如采购合同、检测报告），证明包材来源合法或已停用。
  
• 对没收决定有异议的，及时申请行政复议或提起行政诉讼，维护合法权益。
  

如有具体案件或包材类型，可进一步提供细节，我将为您分析法律风险及应对策略。