医院夜班费被认定为违规，主要基于以下几个方面的原因：
津贴补贴管理规定：
- 根据相关文件，津贴补贴包括国家统一规定的津贴补贴和工作性津贴、生活性补贴等。对于违反规定自行新设项目或者继续发放已经明令取消的津贴补贴，以及超过规定标准、范围发放津贴补贴的行为，会被视为违规。夜班费在某些情况下被视为一种额外的津贴补贴，如果缺乏明确的文件支持或超过了规定的标准，就可能被认定为违规。
公立医院性质与财政拨款：
- 虽然公立医院在一定程度上依赖财政拨款，但其财政拨款收入通常只占总收入的一小部分。然而，在津贴补贴的管理上，公立医院仍需遵循相关规定。如果夜班费的发放没有明确的政策依据或超出了规定的范围，就可能面临被认定为违规的风险。
夜班费与绩效工资的区别：
- 有人认为医院“夜班费”本质上是晚班的“绩效工资”，但这一观点并不总是被认可。绩效工资通常与员工的工作表现、工作量或工作成果直接相关，而夜班费则更多地被视为对员工在非正常工作时间工作的补偿。如果夜班费被视为一种额外的、缺乏明确依据的津贴，就可能被认定为违规。
劳动法与超时工作报酬：
- 从劳动法的角度来看，员工在超时工作时应获得相应的报酬。然而，在实际操作中，夜班费的发放往往与劳动法的规定存在差距。如果医院未能按照劳动法规定支付超时工作报酬，而仅以夜班费作为补偿，这种做法可能面临法律上的挑战。同时，如果夜班费被取消，而医院又未能提供合理的超时工作报酬，这也可能引发劳动纠纷。
针对医院夜班费被认定为违规的情况，以下是一些建议：
- 医院应完善绩效工资制度：将夜班费纳入绩效工资总量内合规发放，避免将其视为一种额外的、缺乏明确依据的津贴。这样既可以保障员工的合法权益，又可以避免违规风险。
- 加强与员工的沟通：医院应与员工充分沟通夜班费的发放依据和标准，确保员工对夜班费有清晰的认识和理解。这有助于减少因信息不对称而引发的纠纷。
- 关注劳动法规定：医院应密切关注劳动法的相关规定，确保在超时工作报酬的支付上符合法律要求。这有助于维护员工的合法权益，避免劳动纠纷的发生。
如果医院夜班费被取消，而员工认为自己的权益受到了侵害，可以采取以下措施：
- 与医院协商：首先可以尝试与医院进行协商，寻求合理的解决方案。
- 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉，寻求法律援助和保护。
- 考虑法律途径：在必要时，可以考虑通过法律途径来维护自己的合法权益。
医院夜班费被认定为违规是一个复杂的问题，涉及多个方面的因素。如果你或你所在的医院面临类似的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。