核心结论：若车辆追尾后，保险公司对非后车责任造成的变速箱损坏进行了赔付，您可采取以下措施：1. 核查保险条款与责任认定；2. 与保险公司协商或投诉；3. 通过法律途径解决争议。以下为具体分析：

1. 核查保险条款与责任认定

• 保险合同审查：首先需确认保险合同中关于“赔偿范围”和“责任免除”的条款。若变速箱损坏明确不属于追尾事故的直接损失（如事故前已存在故障），保险公司可能存在误赔或违规操作。
• 事故责任认定：检查交警出具的《交通事故责任认定书》，若认定后车仅对追尾部分负责，而变速箱损坏与事故无因果关系，保险公司无权赔付该部分。

2. 与保险公司协商或投诉

• 协商解决：联系保险公司，要求其提供赔付依据（如定损报告、第三方鉴定）。若无法证明变速箱损坏与事故相关，可要求撤销赔付或追回款项。
• 投诉渠道：若协商无果，可向当地银保监会（12378热线）投诉，或通过保险公司总部客服渠道反映问题，要求介入调查。

3. 通过法律途径解决争议

• 起诉保险公司：若保险公司坚持错误赔付，您可向法院提起诉讼，要求确认赔付无效。需准备证据包括：事故责任认定书、维修记录、变速箱损坏原因鉴定报告等。
• 反诉后车责任：若变速箱损坏实际由其他原因（如车辆本身质量问题）导致，您可向变速箱生产商或销售商主张权利，但需另行提起产品责任纠纷诉讼。

关键提醒

• 保留证据：务必保存所有与事故、维修、保险沟通相关的书面材料及录音，以备后续维权。
• 及时行动：保险赔付争议存在时效限制，建议尽快处理，避免超过诉讼时效。

若有进一步疑问或需协助处理具体案件，可直接向我咨询，我将结合具体证据提供法律意见。