结论前置：用人单位在辞退被追究刑事责任的员工时，必须遵循严格的法律流程，包括确认员工被追究刑事责任的事实、通知工会、发出辞退通知、办理离职手续等，以确保辞退行为的合法性和合规性。
一、确认员工被追究刑事责任的事实
获取法律文书：
- 用人单位应通过要求员工提供或向相关司法机关核实，取得法院的有罪判决书、裁定书等有效法律文件，作为辞退的合法依据。
- “被依法追究刑事责任”包括但不限于被人民法院判处刑罚（含主刑和附加刑）、被免予刑事处罚，以及被人民检察院不起诉但认定犯罪情节轻微等情况。行政拘留、劳动教养等不属于此范畴。
核实事实真实性：
- 用人单位在获取法律文书后，应仔细核实其真实性，确保员工确实已被依法追究刑事责任。
二、通知工会
通知义务：
- 若用人单位设有工会，应事先将辞退原因通知工会，并提供相关法律文书作为证明。
- 工会有权对辞退事宜进行审查，并出具书面意见。用人单位应认真考虑工会的意见，并将处理结果书面通知工会。
无工会情况：
- 若用人单位未设立工会，则无需履行通知工会的程序，但仍需确保辞退行为的合法性和合规性。
三、发出辞退通知
制作书面通知：
- 辞退通知应明确辞退原因、依据的法律条款、生效日期及申诉途径和期限。
- 通知内容应清晰、准确，避免产生歧义。
有效送达：
- 采用直接送达（要求签收）、邮寄送达（保留凭证）等方式，确保通知已有效传达给员工。
- 如员工拒绝签收，可通过录音录像记录送达过程，以证明通知已送达。
四、办理离职手续
工作交接：
- 安排员工与相关同事或部门进行工作交接，确保公司业务不受影响。
- 交接过程应详细记录，以备后续查证。
结算费用：
- 按照法律规定和劳动合同约定，结算员工至辞退生效日期的工资。
- 根据具体情况判断是否支付经济补偿、未休年假工资等。同时，扣除员工应承担的费用，如借款、罚款等。
出具离职证明：
- 为员工出具离职证明，注明劳动合同期限、解除劳动合同的日期、工作岗位及工作年限等信息。
- 离职证明是员工后续就业的重要依据，应确保其真实性和准确性。
社保和档案转移：
- 及时办理社会保险减员手续，确保员工社保关系顺利转移。
- 协助员工办理档案转移手续，确保其档案得到妥善保管。
五、报告与备案
- 用人单位应将员工被辞退的情况报告给当地劳动行政管理部门备案，以确保整个辞退流程的合规性。
- 备案过程应提供相关证明材料，如辞退通知、法律文书等。
六、注意事项
合法性与合规性：
- 确保解除决定的合法性，避免因违法解除而承担法律责任。
- 遵守解除合同的程序和条件，如提前通知、支付工资等。
合理行使解除权：
- 建议在知道或应当知道员工被追究刑事责任后合理期限内（如6个月）行使解除权，避免超期风险。
- 超期行使解除权可能导致解除行为无效，从而引发劳动纠纷。
后续事宜处理：
- 妥善处理员工的后续事宜，如离职证明、社保转移等。
- 确保员工权益得到保障，避免引发不必要的法律纠纷。
总结与建议：辞退被追究刑事责任的员工是一个涉及多重法律程序和员工权益的复杂过程。用人单位务必严格遵循相关法律法规，确保辞退流程的合法性、合规性。在操作过程中，建议用人单位咨询专业律师或法律顾问，以获取更具体的法律指导和建议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。