当工资由第三方代发而引发纠纷需要进行劳动仲裁时，关键在于明确自身与用人单位之间存在劳动关系，并按照以下步骤进行仲裁：
一、明确劳动关系与收集证据
证明劳动关系：
- 首要任务是收集并保留能够证明你与用人单位之间存在劳动关系的证据。这些证据包括但不限于劳动合同、工作证、考勤记录、工作邮件、工作群聊天记录、工作成果文件等。
- 特别是如果劳动合同中有关于第三方代发工资的约定条款，这将直接证明代发的合法性与依据，是关键的书证。
工资发放证据：
- 收集银行工资流水明细，确保明细中明确显示第三方支付主体、支付金额、支付日期等关键信息，最好能有备注说明是工资款项。
- 如果有工资条，也应妥善保留，工资条能清晰地显示工资的具体数额、发放时间等信息。
其他相关证据：
- 如果有与用人单位关于工资代发的沟通记录，如聊天记录、邮件等，其中提及第三方代发事宜及相关细节，也是有力的证据。
- 同事证言，如果有同事愿意出庭作证，证明他们同样是第三方代发工资，可以进一步增强证据链条。
二、提交仲裁申请
准备申请书：
- 向当地的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请。申请书里要详细列出双方的基本信息，包括你的姓名、性别、年龄、住址、联系方式，以及用人单位的名称、地址、法定代表人或主要负责人的姓名、职务等。
- 明确仲裁请求，如要求用人单位支付拖欠的工资、经济补偿金等具体要求。
- 在事实和理由部分详细阐述工资由第三方代发的整个情况以及具体的纠纷细节，比如代发方未按时足额发放工资的具体时间、数额等。
提交证据材料：
- 将收集到的所有证据材料一并提交给仲裁委员会，包括劳动合同、工资流水明细、工资条、工作证、考勤记录、沟通记录等。
三、参与仲裁过程
参加仲裁庭审：
- 按照仲裁委员会的要求参加仲裁庭审，陈述事实、提供证据，并回答仲裁员的问题。
- 在庭审过程中，要保持冷静和理性，如实陈述事实，不要夸大或缩小事实。
接受调解或裁决：
- 仲裁委员会会依据双方提供的证据以及各自的陈述进行深入调查、积极调解或者作出最终裁决。
- 如果双方达成调解协议，要认真阅读协议内容，确保自己的权益得到保障。
- 如果对仲裁裁决结果不满意，可以在规定的期限内提起诉讼。
四、后续维权
对裁决结果不满的维权：
- 如果对仲裁裁决结果不满意，可以在收到裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。
- 提起诉讼时，要准备好相关的证据材料，并按照法院的要求填写起诉状、缴纳诉讼费等。
持续关注案件进展：
- 在诉讼过程中，要持续关注案件的进展，及时与法院沟通，了解案件的审理情况。
- 如果需要补充证据或进行其他法律程序，要积极配合法院的要求。
在处理工资由第三方代发的劳动仲裁案件时，一定要通过合法的途径来维护自身的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。