总的算在公司六个月。这里我们主要从劳动关系的存续期间来进行理解和计算。
劳动关系存续期间的理解
首先，要明确的是，员工在公司上班的时间，以及因非工伤原因而请的病假时间，都是劳动关系存续期间的一部分。也就是说，从员工正式入职开始，到其离职（如果有的话）为止，这段时间都算作在公司的时间。
具体计算
实际工作时间：您在公司实际工作了三个多月，这是明确的劳动关系存续时间。
病假时间：随后，您因非工伤原因请了三个月的病假。根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。在这个期间内，您虽然未实际工作，但劳动关系仍然存续。
总时间计算：将实际工作时间和病假时间相加，即三个多月的实际工作时间加上三个月的病假时间，总的算在公司的时间就是六个月左右（具体月份可能因实际工作天数的多少而略有差异，但大致可以这样计算）。
注意事项
医疗期的具体规定：虽然您的情况是非工伤病假，但医疗期的具体长度可能因地区、公司政策以及您的工龄等因素而有所不同。不过，这并不影响我们计算总的在公司时间，只是说明在医疗期内，您的劳动关系是受到保护的。
劳动关系的延续：在病假期间，除非有法定或约定的解除事由，否则公司不能单方面解除与您的劳动关系。因此，这段时间仍然算作在公司的时间。
后续行动建议：如果您对病假期间的工资支付、医疗期长度等有任何疑问，或者担心公司可能违反相关法律规定，可以随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。
综上所述，从您入职开始到病假结束，总的算在公司的时间是六个月左右。如果有任何其他法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。