员工在大病期间合同自动到期，用人单位仍需发放薪资。具体分析如下：
一、法律对医疗期合同及薪资的规定
根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条及相关规定，员工在患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内，即使劳动合同到期，用人单位也不得单方面解除合同，且需要继续按时发放薪酬待遇。这意味着，医疗期内合同自动延续，用人单位需支付病假工资或疾病救济费。
二、病假工资或疾病救济费的支付标准
病假工资或疾病救济费的数额可以低于所在地的最低工资水平，但无论如何都不得低于这一标准的百分之八十。这一规定确保了员工在医疗期内能够获得基本的生活保障。
三、医疗期的确定
医疗期的具体时间长度要根据员工的实际工龄以及在本企业的服务年数来综合考量和确定，一般为3个月到24个月不等。例如，实际工作年限不满十年，在本单位工作年限五年以下的，医疗期是三个月；五年及以上的，医疗期是六个月等不同标准。
四、医疗期满后的处理
若医疗期满，员工不能从事原工作，也不能从事用人单位另行安排的工作，用人单位可以提前三十日以书面形式通知员工本人或者额外支付一个月工资后，解除劳动合同，但应按规定支付经济补偿。这一规定既保护了员工的合法权益，也考虑了用人单位的实际情况。
五、用人单位违法解除合同的后果
若用人单位在员工医疗期内擅自解除劳动关系，那就会被视为是违法的行为。员工有权通过法律途径维护自己的合法权益，如要求用人单位继续履行劳动合同，或者要求其支付赔偿金等。
举例说明：
假设某员工在公司工作五年，突发大病需住院治疗，此时其劳动合同即将到期。根据法律规定，该员工的劳动合同应延续至医疗期结束。在医疗期内，公司需按规定支付其病假工资或疾病救济费。若医疗期满后，该员工仍不能从事原工作或公司另行安排的工作，公司可提前三十日书面通知或额外支付一个月工资后解除劳动合同，并支付经济补偿。
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