在行政诉讼中，若被告行政机关未提交事实证据，法院通常会认定该行政机关未履行举证责任，进而可能判定其行政行为违法或撤销该行政行为。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、法律原则与规定
举证责任原则：
- 在行政诉讼中，被告行政机关对其作出的行政行为负有举证责任，这是行政诉讼的基本原则之一。根据《中华人民共和国行政诉讼法》第三十四条：“被告对作出的行政行为负有举证责任，应当提供作出该行政行为的证据和所依据的规范性文件。”
未举证的后果：
- 若被告行政机关未在法定期限内提交证据，或者提交的证据不足以证明其行政行为的合法性，法院将视为其未履行举证责任。根据《中华人民共和国行政诉讼法》第六十七条：“被告应当在收到起诉状副本之日起十五日内向人民法院提交作出行政行为的证据和所依据的规范性文件，并提出答辩状。”若未按时提交，法院有权根据已有证据和案件情况作出判决。
二、法院认定与判决
认定违法：
- 当被告行政机关未提交事实证据时，法院通常会认定该行政机关未履行举证责任，进而可能判定其行政行为违法。这是因为行政机关在作出行政行为时，必须基于充分的事实和法律依据，若无法提供这些证据，则无法证明其行政行为的合法性。
撤销行政行为：
- 在某些情况下，法院可能会直接撤销被告行政机关的行政行为。这通常发生在行政行为明显违法或侵犯原告合法权益的情况下。撤销行政行为意味着该行为自始无效，对原告不再产生法律效力。
三、特殊情况与例外
原告举证：
- 虽然被告行政机关负有举证责任，但在某些特殊情况下，原告也可能需要承担一定的举证责任。例如，在行政不作为案件中，原告可能需要证明其曾向被告提出过申请或请求，而被告未予答复或处理。然而，这并不改变被告行政机关对其行政行为合法性的主要举证责任。
法院调查取证：
- 在某些情况下，法院可能会根据案件需要主动调查取证。然而，这并不意味着被告行政机关可以免除其举证责任。法院调查取证通常是在被告未提交充分证据或证据存在疑问时进行的补充手段。
四、法律建议与后果
对被告行政机关的建议：
- 被告行政机关在行政诉讼中应高度重视举证责任，确保在法定期限内提交充分、有效的证据。若因特殊原因无法按时提交证据，应及时向法院申请延期并说明理由。
对原告的建议：
- 原告在行政诉讼中应积极配合法院工作，提供必要的证据和材料。同时，原告也可以关注被告行政机关的举证情况，若发现其未履行举证责任或提交的证据存在疑问，可以及时向法院提出异议或申请调查取证。
法律后果：
- 若被告行政机关未提交事实证据导致法院认定其行政行为违法或撤销该行政行为，被告行政机关可能需要承担相应的法律责任和后果。这包括但不限于重新作出行政行为、赔偿原告损失等。
综上所述，被告行政机关在行政诉讼中未提交事实证据时，法院通常会认定其未履行举证责任，并可能据此判定其行政行为违法或撤销该行政行为。因此，被告行政机关应高度重视举证责任，确保在法定期限内提交充分、有效的证据以支持其行政行为的合法性。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。