公司不能扣除怀孕女员工产检假工资，这是法律明确规定的权益。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

法律角度

根据《女职工劳动保护特别规定》第六条，怀孕女职工在劳动时间内进行产前检查，所需时间应计入劳动时间。这意味着，女职工在产检期间，虽然未实际从事工作，但法律上视其为出勤，享受与正常工作相同的待遇，用人单位不得因此扣减女员工的工资。

实际操作角度

1. 了解单位流程：为避免不必要的纠纷，建议女职工提前了解所在单位关于产检请假的具体流程和要求，确保按照规定履行请假手续。
2. 保留相关凭证：产检期间，女职工应妥善保留产检报告、挂号单等相关凭证，以备不时之需，作为自己合法产检的证据。

维权途径

如果用人单位违反法律规定，侵害了女职工的产检权益，女职工有权通过以下途径维护自己的合法权益：

1. 与单位协商：首先，可以尝试与用人单位进行协商，寻求和解。
2. 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉，由劳动行政部门责令用人单位限期支付劳动报酬。
3. 申请劳动仲裁：女职工还可以向劳动仲裁部门提出申诉，通过法律程序维护自己的合法权益。
4. 提起诉讼：在必要时，女职工可以直接向法院起诉，要求用人单位承担相应的法律责任。

特殊情况说明

虽然产检假工资不得扣除，但如果是女员工因个人原因在怀孕期间请事假，单位有权按照规章制度扣除相应的事假期间工资。不过，单位的规章制度必须合法、合理且经过民主程序制定并向员工公示，否则不能作为扣款依据。

建议：

• 女职工应了解自己的权益，遇到类似问题及时咨询专业律师（即向我咨询）或相关机构以寻求帮助。
• 用人单位应加强相关法律法规的学习与培训，确保合规操作，避免侵犯女职工的合法权益。

保护孕妇的合法权益是社会的共同责任。任何单位都应严格遵守相关法律法规，确保女职工的合法权益得到充分保障。