结论前置：公司用员工的年休假去补工作日是否合法，需分情况讨论。若公司安排年休假时考虑了员工意愿，并依法进行了统筹安排，则合法；若未经员工同意或未依法安排，则可能不合法。

合法情形分析

1. 公司依法统筹安排年休假：

   • 根据《职工年休假条例》第五条，单位根据生产、工作的具体情况，并考虑职工本人意愿，可以统筹安排职工年休假。这意味着，公司在安排年休假时，有一定的自主权，但前提是必须考虑职工的意愿。
   • 若公司因生产、工作需要，确实无法安排职工在正常工作日休息，而选择用年休假来补工作日，且这一安排得到了职工的同意，那么这种做法是合法的。

2. 年休假工资报酬的支付：

   • 如果公司因工作需要不能安排职工休年假，且经职工本人同意不安排休假的，公司应当按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬。这是对公司未安排年休假的一种补偿机制，也是保障职工权益的重要措施。

不合法情形分析

1. 未经员工同意擅自安排：

   • 如果公司未经员工同意，擅自用年休假去补工作日，这种做法可能侵犯了员工的休息权，因此是不合法的。员工有权拒绝这种安排，并可以要求公司按照法律规定支付年休假工资报酬或安排补休。

2. 未依法支付年休假工资报酬：

   • 即使公司因工作需要不能安排职工休年假，且得到了职工的同意，但如果公司未按照法律规定支付300%的日工资收入作为年休假工资报酬，那么这种做法也是不合法的。员工有权要求公司补发工资报酬，并可以依法维护自己的权益。

相关法律依据

• 《职工年休假条例》第五条：单位根据生产、工作的具体情况，并考虑职工本人意愿，统筹安排职工年休假。年休假在1个年度内可以集中安排，也可以分段安排，一般不跨年度安排。单位因生产、工作特点确有必要跨年度安排职工年休假的，可以跨1个年度安排。单位确因工作需要不能安排职工休年假的，经职工本人同意，可以不安排职工休年假。对职工应休未休假天数，单位应当按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬。

操作建议

• 对于公司：在安排年休假时，应充分考虑员工的意愿，并依法进行统筹安排。如果因工作需要不能安排员工休年假，应得到员工的同意，并按照法律规定支付年休假工资报酬。
• 对于员工：如果公司未经同意擅自用年休假去补工作日，或者未依法支付年休假工资报酬，员工应先与公司沟通协商；协商不成时，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

综上所述，公司用员工的年休假去补工作日是否合法，取决于公司是否依法进行了统筹安排，并考虑了员工的意愿，以及是否依法支付了年休假工资报酬。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。