当您在借款合同纠纷中遇到被告不承认合同的情况时，可以采取以下详细且具有深度的措施来维护自己的权益：
一、强化证据链
借款合同本身：
- 借款合同是证明借贷关系存在的最直接证据，它明确了双方的权利义务，包括借款金额、期限、利息等关键条款。
转账记录：
- 转账记录是证明款项实际交付的重要证据。无论是银行转账还是第三方支付平台（如支付宝、微信）的转账记录，都应妥善保存，以证明资金的实际流动。
聊天记录与电话录音：
- 聊天记录和电话录音可以反映借款过程及双方的真实意思表示。例如，双方在借款前的协商、借款后的确认等对话内容，都可以作为辅助证据。
证人证言：
- 如果有目击者见证了借款过程，他们的证言也可以作为证据。证人应能够清晰、准确地描述借款场景，包括时间、地点、人物、金额等关键信息。
部分履行行为：
- 如果借款有部分履行行为，如部分还款、支付利息等，这些行为也可以辅助证明借贷关系的存在。
二、协商与调解
尝试协商：
- 在采取法律行动之前，可以尝试与被告进行协商，看是否能够达成和解。协商过程中，可以明确提出自己的诉求和依据，同时听取被告的意见和解释。
申请调解：
- 如果协商无果，可以考虑向人民调解委员会等第三方调解机构申请调解。调解机构会依据事实和法律，促使双方达成和解协议。该协议具有一定法律效力，如果被告不履行，您可以依据协议向法院申请强制执行。
三、法律途径
准备起诉材料：
- 如果协商和调解都无法解决问题，那么向法院提起诉讼是常见的解决方式。起诉时，需要准备好起诉状、借款合同及相关佐证证据。起诉状应明确诉求、事实和理由，以及证据清单。
法院审理与判决：
- 法院会根据双方提供的证据进行审理，并判断借贷事实是否成立。如果证据充分，法院会支持您的诉求，判决被告还款。如果被告仍不履行判决，您可以向法院申请强制执行。
注意诉讼时效与管辖权：
- 在提起诉讼时，要注意诉讼时效的问题。一般来说，借款合同的诉讼时效为三年，自知道或应当知道权利被侵害之日起计算。
- 同时，要注意管辖权的问题。根据相关法律规定，民间借贷纠纷通常由被告住所地或合同履行地法院管辖。如果借贷合同有约定履行地，且约定的履行地明确，则依约定确定管辖法院；如果没有约定或约定不明，则以接受货币一方所在地为合同履行地。在民间借贷中，出借人起诉要求借款人还钱时，出借人是接受货币一方，此时出借人住所地法院有管辖权。
四、特殊情形处理
诈骗罪与拒不执行判决、裁定罪：
- 如果债务人在借款时就有非法占有目的，通过虚构事实等手段骗取借款，可能构成诈骗罪。这种情况会面临刑事处罚。
- 如果法院判决后，债务人有能力执行而拒不执行，情节严重的，会触犯拒不执行判决、裁定罪，也会被追究刑事责任。
无转账记录的起诉：
- 即便没有转账记录，只要借款合同真实有效，且能通过其他证据（如聊天记录、证人证言等）形成完整证据链，起诉仍有可能获得法院支持。但缺乏转账记录可能会增加出借人证明借款交付的难度。
综上所述，当遇到借款合同纠纷且被告不承认合同的情况时，您应首先强化证据链，尝试协商与调解；如果无法解决问题，则通过法律途径维护自己的权益。在整个过程中，要注意诉讼时效与管辖权的问题，并准备好充分的证据来支持自己的诉求。