关于第三人侵权与雇主责任竞合时，雇员自行扣除第三人可以赔偿部分性质的认定，这主要涉及到不真正连带责任的处理原则。以下是我从不同角度为你进行的分析：

一、法律责任竞合的基本原则

在第三人侵权与雇主责任竞合的情况下，按照我国法律的规定，这属于一种不真正连带责任。不真正连带责任是指各债务人基于不同的发生原因而对于同一债权人负有以同一给付为标的的数个债务，因一个债务人的履行而使全体债务均归于消灭的责任。在此情况下，雇员（即被侵权人）有权选择向第三人或雇主中的任何一方要求赔偿。

二、雇员自行扣除第三人赔偿部分的性质

1. 选择赔偿方的权利：

   • 雇员在遭受第三人侵权和雇主责任竞合时，有权选择向第三人或雇主索赔。这是法律赋予雇员的选择权，旨在保护其合法权益。

2. 扣除行为的合法性：

   • 如果雇员选择向雇主索赔，并自行扣除第三人可能赔偿的部分，这种行为在法律上并不被直接禁止，但需要注意其合理性和合法性。
   • 合理性在于，雇员可能基于实际需要（如急需医疗费用）而先行向雇主索赔，并计划后续从第三人处获得补偿。
   • 合法性则取决于具体操作方式。如果雇员在扣除时未与雇主或第三人进行充分沟通，或存在欺诈、隐瞒等行为，则可能引发法律纠纷。

3. 雇主追偿权：

   • 雇主在赔偿完毕后，有权向第三人追偿。这是法律赋予雇主的权利，旨在平衡雇主与第三人之间的责任分担。
   • 如果雇员自行扣除了第三人可能赔偿的部分，而雇主又向第三人追偿了相同金额，则可能引发重复赔偿的问题。此时，需要根据具体情况判断雇员扣除行为的合理性，并可能涉及返还或调整赔偿金额的问题。

三、实际操作中的建议

1. 明确赔偿顺序和金额：

   • 雇员在遭受侵权后，应尽快与雇主和第三人沟通，明确赔偿顺序和金额。这有助于避免后续纠纷和重复赔偿的问题。

2. 保留相关证据：

   • 雇员应保留与侵权事件相关的所有证据，包括医疗费用单据、误工证明、侵权行为证据等。这些证据在后续索赔和追偿过程中将起到关键作用。

3. 咨询专业律师：

   • 在处理此类复杂法律问题时，建议雇员咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供法律意见和解决方案，帮助雇员维护其合法权益。

举例说明：假设雇员在工作时间因第三人侵权导致受伤，同时雇主也存在一定过错（如未提供安全的工作环境）。此时，雇员可以选择向第三人或雇主索赔。如果雇员选择向雇主索赔，并自行扣除了第三人可能赔偿的医疗费用部分，那么雇主在赔偿完毕后有权向第三人追偿该部分费用。但如果雇员扣除的金额超过了第三人实际应赔偿的金额，或者存在其他不合理情况，则可能引发法律纠纷。

综上所述，第三人侵权与雇主责任竞合时，雇员自行扣除第三人可以赔偿部分的性质认定需要综合考虑法律责任竞合的基本原则、扣除行为的合理性和合法性以及雇主追偿权等因素。如果你在此类问题上还有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。