超过起诉期限（这里应理解为超过诉讼时效），法院应驳回诉讼请求而非驳回起诉。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律依据与核心区别

1. 驳回起诉的法定情形

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，驳回起诉主要适用于原告主体不适格、被告不明确、重复起诉等程序性问题。其核心在于案件未满足受理条件，属于立案阶段的程序性审查结果。例如，若原告起诉的被告不明确，法院将裁定驳回起诉。

2. 驳回诉讼请求的实体性判断

   • 当案件通过程序审查进入实体审理阶段，若原告主张的权利因超过诉讼时效而丧失胜诉权，法院则需依据《中华人民共和国民法典》的相关规定进行实体裁判。此时，虽不否定权利本身的存在，但因时效抗辩成立，判决结果为驳回诉讼请求。例如，在借款纠纷中，若借款已超过诉讼时效，且债务人提出时效抗辩，法院将判决驳回债权人的诉讼请求。

二、超诉讼时效的法律后果分析

• 诉讼时效届满的本质：债务人取得时效抗辩权，但债权本体仍存续。这意味着，虽然债务人可以拒绝履行债务，但债权关系并未因此消灭。例如，甲欠乙10万元，逾期3年后乙起诉要求还款，此时甲可以主张诉讼时效抗辩，但甲乙之间的债权债务关系仍然存在。

• 法院的裁判逻辑：

  • 若债务人提出时效抗辩，法院经审查确认超期，则判决驳回诉讼请求。这是法院在实体审理阶段，根据时效抗辩成立而作出的裁判结果。
  • 若债务人未提出抗辩，法院不得主动适用时效规定，仍需对债权债务进行实质审理。这体现了法院在审理案件时的被动性和中立性。

三、典型案例解析

案例：张三于2018年5月借给李四5万元，约定半年还款。2023年6月张三起诉要求还款，李四以超诉讼时效为由抗辩。

裁判结果：法院认定借款事实存在，但因超过3年诉讼时效且李四已行使抗辩权，最终判决驳回张三的诉讼请求。此案例中，法院既未否定借贷关系，也未因程序问题驳回起诉，而是通过实体审查，根据时效抗辩成立作出了驳回诉讼请求的裁判。

四、特殊情形说明

• 当事人未提出诉讼时效抗辩：若债务人未提出诉讼时效抗辩，法院不得主动适用时效规定进行裁判。这体现了法院在审理案件时的被动性和对当事人诉讼权利的尊重。

• 当事人自愿履行：即使超过诉讼时效，当事人自愿履行的，不受诉讼时效限制。履行后，债务人不得以诉讼时效已过为由要求返还。这体现了法律对当事人自愿履行行为的认可和保护。

总结与建议：

• 在诉讼过程中，若对方提出诉讼时效已过的抗辩，且法院审查后确认确实超过诉讼时效，通常会判决驳回原告的诉讼请求，而非驳回起诉。
• 超过诉讼时效主要影响的是胜诉权，而非起诉权。因此，即使超过诉讼时效，当事人仍有权向法院提起诉讼，但可能面临败诉的风险。
• 若您正遇到类似法律难题，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。