结论：劳务合同签的公司但用另一个公司发工资，这一行为是否合法需视具体情况而定，不能一概而论。

合法情形

1. 存在劳务派遣协议：

   • 若实际用工单位与劳务派遣公司签订了劳务派遣协议，且该协议明确约定了工资支付等事项，那么由劳务派遣公司发放工资是合法的。这种情况下，劳务派遣公司作为用人单位，与劳动者签订劳动合同，并负责工资支付等事宜，而实际用工单位则负责劳动者的日常管理和工作安排。

2. 有明晰的合同协议及合法商业目的：

   • 若公司之间存在合法的业务合作或关联关系，且通过另一个公司发放工资是基于合理的商业安排（如集团内部资金调配、税务优化等），同时能够确保劳动者的合法权益得到充分保护（如及时足额支付工资、缴纳社会保险等），那么这种操作也可能被视为合法。

违法情形

1. 逃避法律责任或劳动监管：

   • 若公司以另一个公司名义发放工资，是为了逃避法律责任（如未签订劳动合同、未缴纳社会保险等）或劳动监管，那么这种行为就可能构成违法。这种情况下，公司可能试图通过隐藏真实的劳动关系来规避法律义务，损害劳动者的合法权益。

2. 导致劳动关系界定不清：

   • 根据劳动法律规定，雇员与实际聘用者之间存在明确的劳资关系，薪资应当由直接用工单位负责发放。若透过第三方公司发放薪酬，且无法提供合理合规的解释及依据，就可能导致劳动关系界定不清，从而引发劳动纠纷。这种情况下，劳动者的权益可能无法得到充分保障。

法律建议

• 核实工资支付主体：劳动者应核实自己的工资是由哪个公司支付的，并了解该公司与自己签订劳务合同的公司之间的关系。
• 要求明确劳动关系：若发现工资支付主体与劳务合同签订主体不一致，劳动者应要求相关公司明确劳动关系，并确保自己的合法权益得到充分保护。
• 保留相关证据：劳动者应保留与工资支付、劳动关系等相关的证据（如工资条、银行流水、劳务合同等），以便在发生纠纷时维护自己的权益。
• 及时咨询专业律师：若劳动者对自己的劳动关系或工资支付等问题存在疑问，应及时咨询专业律师，以便得到专业的法律建议和帮助。

举例：假设小张与A公司签订了劳务合同，但工资却由B公司发放。若A公司与B公司之间存在劳务派遣协议，且该协议明确约定了工资支付等事项，那么小张的工资由B公司发放就是合法的。反之，若A公司与B公司之间不存在这样的协议，且无法提供合理合规的解释及依据，那么这种行为就可能构成违法。

总结：劳务合同签的公司但用另一个公司发工资是否合法，需根据具体情况来判断。劳动者应了解自己的劳动关系和工资支付情况，并确保自己的合法权益得到充分保护。若存在疑问或纠纷，应及时咨询专业律师。