总公司有建筑资质时，分公司签订的建设工程施工合同在符合一定条件下是有效的。以下是对这一问题的详细分析：
一、有效情形
分公司合法登记并获得总公司授权：
- 分公司如果在工商部门进行了合法登记并领取了营业执照，且获得了总公司的明确授权来签订施工合同，那么该合同通常是有效的。因为分公司作为总公司的派出机构，在授权范围内进行的民事法律行为，对总公司发生效力。
合同内容合法且未超越经营范围：
- 施工合同的内容必须遵守国家法律法规的强制性规定，不得违反公共利益和社会公德。同时，合同内容应未超越分公司的经营范围（在总公司授权范围内）。只有合同内容合法且未超越经营范围，才能确保合同的效力。
合同签订程序合法：
- 建设工程领域通常有严格的招投标程序要求。分公司签订的施工合同应遵守这些法定程序，如应该进行招标而进行了招标，且在招标过程中未存在串标、围标等违法行为。
二、可能无效的情形
分公司未获得总公司授权且超越经营范围：
- 如果分公司未获得总公司的明确授权，且签订的施工合同超越了其经营范围（特别是超越了总公司授权的范围），并且该行为违反了法律、行政法规的强制性规定，那么合同可能被认定为无效。
合同内容违法或违反公共利益：
- 如果施工合同的内容违反了国家法律法规的强制性规定，或者违反了公共利益和社会公德，那么合同也是无效的。
违反招投标等法定程序：
- 如前所述，建设工程领域有严格的招投标程序要求。如果分公司签订的施工合同违反了这些法定程序，那么合同可能会被认定为无效。
三、法律建议
确保分公司获得总公司明确授权：
- 在签订施工合同前，总公司应明确授权分公司进行签约，并确保授权范围清晰、具体。
审查合同内容合法性：
- 在签订施工合同前，应仔细审查合同内容，确保其不违反国家法律法规的强制性规定，不违反公共利益和社会公德。
遵守招投标等法定程序：
- 在签订施工合同前，应确保已经遵守了相关的招投标等法定程序，避免因程序违法而导致合同无效。
及时咨询专业律师：
- 在签订施工合同过程中，如果遇到任何法律问题或疑虑，应及时咨询专业律师，以确保合同的合法性和有效性。
总结来说，总公司有建筑资质时，分公司签订的建设工程施工合同在符合一定条件下是有效的。但为了避免潜在的法律风险，建议在签订合同前确保分公司获得总公司的明确授权、审查合同内容的合法性、遵守招投标等法定程序，并在必要时咨询专业律师。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询。