当您在申请劳动仲裁期间发现工伤认定时间已经超过法定期限时，确实会面临一些挑战，但仍有补救的途径。以下是一些详细的建议，希望能帮助您妥善处理这一问题：

一、明确超期原因

首先，您需要明确工伤认定超期的原因。这可能是因为：

1. 用人单位未及时申请：根据规定，用人单位应在事故伤害发生之日或被诊断、鉴定为职业病之日起30日内申请工伤认定。若因用人单位原因导致超期，您有权主张其承担工伤保险待遇赔偿责任。

2. 不可抗力等正当理由：如因自然灾害、战争等不可抗力因素导致无法及时申请，被耽误的时间不计入申请期限。

3. 自身疏忽：若因您或您的近亲属、工会组织未在1年内及时申请，且无合理理由，则劳动保障行政部门可能不再受理。

二、补救措施

针对不同原因，您可以采取以下补救措施：

1. 因用人单位原因超期：

   • 与用人单位协商，要求其承担工伤保险待遇赔偿责任。
   • 若协商无果，可考虑通过劳动仲裁或民事诉讼途径解决。

2. 因不可抗力等正当理由超期：

   • 向劳动保障行政部门说明情况，并提供相应证明（如灾害证明、医疗记录等），请求其审查是否存在合理情形，并酌情处理。
   • 若劳动保障行政部门拒绝受理，您可通过行政复议或行政诉讼等法律程序，要求其重新作出认定决定。

3. 尝试民事诉讼：

   • 若无法通过行政程序解决，您可尝试通过民事诉讼途径解决。法院会根据双方提供的证据，判断是否属于工伤及责任承担等问题。但需注意，民事诉讼中对工伤认定的审查标准可能与行政程序有所不同，且超期后维权可能较为困难。

三、注意事项

1. 及时主张权利：无论采取哪种途径，都应尽快行动，避免因时间拖延导致证据灭失或维权难度增加。

2. 准备充分证据：在申请行政复议、提起行政诉讼或民事诉讼时，应准备充分的证据来支持您的主张，如劳动关系证明、工伤事故证明、医疗记录等。

3. 寻求专业帮助：若您对法律程序不熟悉或感到困惑，建议寻求专业律师或法律援助机构的帮助，以确保您的权益得到妥善维护。

四、后续流程

若您成功获得工伤认定，接下来可能需要关注以下流程：

1. 劳动能力鉴定：根据工伤认定结果，申请劳动能力鉴定，以确定您的伤残等级和后续治疗、康复需求。

2. 工伤保险待遇申请：根据劳动能力鉴定结果，向社会保险经办机构申请工伤保险待遇，包括医疗费用、伤残津贴、一次性伤残补助金等。

3. 劳动仲裁或诉讼：若与用人单位在工伤保险待遇方面存在争议，可通过劳动仲裁或民事诉讼途径解决。

总之，当劳动仲裁工伤认定时间超过法定期限时，您仍有补救的途径。关键在于明确超期原因，采取合适的补救措施，并准备充分的证据来支持您的主张。希望这些建议能对您有所帮助。