当您面临超过劳动仲裁申请期限的情况时，虽然会面临一定的法律挑战，但您仍然有多种合法途径可以尝试来维护自己的权益。以下是我为您详细梳理和分析的处理方式：

一、明确仲裁时效规定及超期原因

首先，您需要了解劳动争议申请仲裁的时效期间通常为一年，这个期限是从您知道或应当知道自己的权利被侵害之日起开始计算的。不过，也存在一些特殊情况，比如因不可抗力或有其他正当理由导致您无法在时效期内申请仲裁，这时时效可以中止，等障碍消除后继续计算。另外，如果您是在劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬引发的争议，那么您申请仲裁不受这一年的时效限制，但劳动关系终止后，您还是需要在一年内提出。所以，您首先要做的是确定超期的具体原因，看看是否存在时效中止、中断的法定事由。

二、与用人单位协商

即使仲裁时效已经过了，与用人单位进行友好协商仍然是一个不错的选择。您可以通过诚恳的沟通，提出自己的合理诉求，看看双方是否能够达成和解协议，这样既能高效解决问题，又能避免不必要的法律纠纷。

三、书面催款或通知

您还可以向用人单位发出催款函或书面通知，明确表明您仍在主张相关权利。虽然这一行为不能直接启动仲裁程序，但在某些情况下，它可能会促使用人单位认可您的诉求，或者基于其他法律事由来解决时效问题。

四、向劳动争议调解组织申请调解

您还可以向依法设立的基层人民调解组织或具有劳动争议调解职能的组织申请调解。即使仲裁时效已经过了，调解组织的介入仍然有助于双方达成调解协议。一旦达成协议，用人单位就应该履行。如果用人单位不履行，您还可以向法院提起诉讼要求其履行。

五、向人民法院提起诉讼

如果协商和调解都没有结果，您还可以直接向人民法院提起诉讼。法院在审理时会审查仲裁时效问题，但如果用人单位没有提出时效抗辩，法院就会进行实体审理，并根据证据和事实作出判决。所以，在起诉前，您一定要确保自己符合起诉条件，并准备好充分的证据。

六、向劳动监察机构投诉

您还可以选择向当地人力资源社会保障行政部门所属的劳动监察机构投诉。劳动监察机构具有协调处理劳动争议的职能，他们可能会为您提供一定的帮助和支持。

七、搜集新证据以证明时效中断或中止

为了证明在诉讼时效期间内存在中断或中止的情况，您需要积极搜集新的证据材料。比如，您曾向用人单位表达诉求的记录、因不可抗力等客观因素导致的无法及时行使请求权的证明等。这些证据对于后续的法律程序非常重要。

八、特定情况下的仲裁申请

如果您是因为不可抗力或其他正当理由导致超过劳动仲裁时效的，比如地震、水灾等自然灾害或个人生病等原因，您可以在障碍消除后向仲裁委员会提出申请。仲裁委员会在核实情况后，应该会受理您的申请。

九、查明申诉中止情况

您还需要查明在劳动仲裁时效期间内是否存在申诉中止的情况。比如，您是否在等待工伤认定、伤残等级鉴定等结果期间。如果存在这些情况，时效期间会相应中止，等中止情况消除后继续计算。

综上所述，即使劳动仲裁期限已过，您仍然有多种途径可以尝试来维护自己的权益。但每种途径都有其特定的条件和程序，所以您在行动前一定要充分了解并遵循相关法律法规。如果您遇到复杂的法律问题，我建议您及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。