公司把无期限合同从总公司变更为新公司合同，这一行为是否合法，需视具体情况而定。以下是从不同角度进行的分析：

1. 合同变更的合法性基础

• 合同主体变更：劳动合同的主体是劳动者和用人单位。若总公司与新公司是关联企业或存在法律上的承继关系（如分公司、子公司且总公司承担连带责任），且变更得到劳动者的书面同意，通常这种变更可能是合法的。但关键在于，合同主体的变更不能损害劳动者的合法权益，如工资、福利、工作条件等。
• 法定程序：根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。若公司未经劳动者同意，单方面将合同主体从总公司变更为新公司，这可能构成违法变更，劳动者有权拒绝并要求原合同继续履行或获得相应补偿。

2. 可能涉及的违法情形

• 未协商一致：如前所述，若公司未与劳动者就合同主体变更进行充分协商并达成一致，单方面实施变更，则可能违反《劳动合同法》中关于劳动合同变更需双方协商一致的规定。
• 损害劳动者权益：若变更导致劳动者的工资、福利、工作条件等核心权益受损，即使劳动者同意变更，也可能因违反公平、等价有偿等法律原则而被认定为违法。
• 逃避法律责任：若公司试图通过变更合同主体来逃避对劳动者的法律责任（如未支付的工资、加班费、经济补偿等），则这种变更显然是非法的。

3. 劳动者的应对措施

• 协商解决：首先，劳动者可以尝试与公司进行协商，表达自己的关切和诉求，寻求双方都能接受的解决方案。
• 投诉举报：若协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉举报公司的违法行为。
• 申请仲裁或诉讼：在必要时，劳动者还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。

4. 特殊情况考虑

• 企业重组或并购：在企业重组或并购过程中，合同主体的变更可能更为复杂。此时，应特别注意变更是否符合相关法律法规的规定，以及是否充分保障了劳动者的权益。
• 关联企业间的调动：若劳动者被从总公司调动至关联企业（如子公司）工作，且这种调动在合同中有明确约定或得到了劳动者的书面同意，同时工作条件、工资福利等未发生不利变化，则这种调动可能是合法的。

建议：面对公司把无期限合同从总公司变更为新公司合同的情况，劳动者应首先了解自己的合同权益和法律法规的相关规定。若对变更存在疑虑或担忧，应及时与公司进行沟通并寻求法律意见。如有需要，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。