结论：电动车商家向厂家索要合格证和发票本身并不违法，但需注意索要的方式和目的必须合法合规。

1. 合法性分析：

   • 合格证和发票是商品合法销售的重要凭证。合格证证明产品符合国家或行业标准，发票则是交易的法律凭证，用于税务申报和消费者维权。商家作为销售方，有权要求厂家提供这些文件，以确保其销售的产品合法合规。
   • 从法律角度讲，商家索要合格证和发票属于正当的商业行为，旨在保障自身和消费者的合法权益，不违反任何法律法规。

2. 注意事项：

   • 方式合法：商家应以合法、合理的方式向厂家索要，不得通过威胁、胁迫或非法手段获取。例如，不得以不支付货款为条件强迫厂家提供，否则可能构成违法行为。
   • 目的正当：索要合格证和发票的目的是为了确保产品合法销售和消费者权益，而非用于其他非法用途，如伪造、变造或倒卖。
   • 合同约定：商家与厂家之间的合作通常会有合同或协议，其中可能明确约定了合格证和发票的提供义务。商家应依据合同约定行使权利，避免违约。

3. 潜在风险：

   • 如果商家以不正当手段索要合格证和发票，或将其用于非法目的，可能面临法律责任，包括但不限于行政处罚、民事赔偿甚至刑事责任。
   • 厂家若拒绝提供合格证和发票，商家可通过合法途径维权，如协商、投诉或诉讼，但不得采取非法手段。

总结：电动车商家向厂家索要合格证和发票是合法的商业行为，但必须确保方式合法、目的正当，并遵守合同约定。如有任何疑问或遇到问题，可以直接向我咨询，我会为你提供详细的法律解答。