结论前置：工伤赔偿的获取与工资发放形式（分两笔发）无直接关联，关键在于确认劳动关系、工伤认定及赔偿项目计算。以下分情况说明：

1. 劳动关系确认是前提

• 无论工资分几笔发放，只要存在事实劳动关系（如签订劳动合同、接受管理、从事有报酬劳动），即可主张工伤赔偿。
• 若未签合同：需通过工资流水、考勤记录、工作证、同事证言等证据证明劳动关系。分两笔发放的工资记录（如银行流水显示两笔转账）可作为证据之一，但需结合其他材料形成完整链条。

2. 工伤认定程序

• 申请时限：用人单位应在事故发生后30日内申请工伤认定；逾期未申请的，劳动者或其近亲属可在1年内直接向社保部门申请。
• 所需材料：工伤认定申请表、劳动关系证明、医疗诊断证明等。工资发放形式不影响认定，但需提交工资记录作为计算赔偿基数的依据。

3. 赔偿项目计算与工资发放形式的关系

• 赔偿基数：工伤赔偿中的“本人工资”通常指事故发生前12个月的平均月缴费工资（社保基数）。若实际工资高于社保基数，部分项目（如一次性伤残补助金）可能按实际工资补足差额，但需通过劳动仲裁确认。
• 分两笔发放的影响：
  • 合法分拆：若两笔款项均属于工资组成部分（如基本工资+绩效），且总额与劳动合同约定一致，不影响赔偿计算。
  • 避税或规避社保：若用人单位通过分两笔发放故意降低社保缴费基数，劳动者可主张按实际工资计算赔偿，并可向社保部门举报用人单位的违法行为。

4. 操作建议

• 第一步：固定证据
  • 收集所有工资发放记录（银行流水需显示转账方为用人单位）、劳动合同、工作证、考勤记录等。
  • 若分两笔发放无合理理由（如未在合同中约定），可要求用人单位出具书面说明。
• 第二步：申请工伤认定
  • 及时提交材料至社保部门，避免超期。
• 第三步：劳动能力鉴定
  • 伤情稳定后申请鉴定，确定伤残等级，作为赔偿依据。
• 第四步：协商或仲裁
  • 若用人单位拒绝赔偿，可向劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁，主张工伤待遇及可能的工资差额。

5. 风险提示

• 若分两笔发放涉及偷逃税费或社保，用人单位可能面临行政处罚，但不影响劳动者主张工伤赔偿的权利。
• 劳动者需注意诉讼时效（工伤认定1年、劳动仲裁1年），避免因拖延丧失权利。

总结：工资分两笔发放不影响工伤赔偿的获取，但需确保劳动关系证据充分、工伤认定及时，并关注工资总额是否真实反映实际收入。如有争议，建议携带完整材料进一步咨询。