关于签合同时年假以工资支付是否可以申请只休假的问题，结论如下：

1. 合同约定与实际履行：

   • 首先，需要查看您与用人单位签订的劳动合同中关于年假的具体约定。如果合同中明确规定了年假可以以工资形式支付，并且您已经接受了这种支付方式，那么从合同约定的角度来看，您可能已经默认了这种安排。然而，这并不意味着您不能申请只休假而不接受工资支付，除非合同中有明确的限制性条款。
   • 在实际操作中，即使合同中有年假以工资支付的约定，您仍然有权向用人单位提出只休假的申请。用人单位在考虑您的申请时，会综合考虑工作安排、员工需求以及相关法律法规的规定。

2. 法律法规的规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，员工享有带薪年休假的权利。用人单位应当保证员工享受年休假，并按照规定支付年休假期间的工资报酬。然而，法律法规并未明确规定年假必须以工资形式支付，还是可以选择只休假。
   • 如果用人单位在合同中约定了年假以工资支付，并且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么这种约定在法律上是有效的。但员工仍然有权根据自身情况提出只休假的申请，用人单位应当予以合理考虑。

3. 实际操作与建议：

   • 如果您希望只休假而不接受工资支付，建议您先与用人单位进行沟通，说明您的需求和理由。用人单位在了解您的情况后，可能会根据工作安排和员工需求，给予您相应的休假安排。
   • 如果用人单位拒绝您的申请，并且您认为这种拒绝违反了法律法规或合同约定，您可以考虑通过劳动争议调解、仲裁或诉讼等途径来维护自己的合法权益。

总结与建议：

• 签合同时年假以工资支付并不妨碍您申请只休假。您有权根据自身情况提出只休假的申请，并与用人单位进行沟通协商。
• 如果用人单位拒绝您的申请，并且您认为这种拒绝不合理或违法，建议您及时咨询专业律师（如我刘丰铭律师，擅长刑事辩护、经济纠纷、合同纠纷领域），了解自己的法律权益和维权途径。
• 在未来的合同签订过程中，建议您仔细阅读合同条款，特别是关于年假、工资支付等关键内容的约定，确保自己的合法权益得到充分保障。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。