公司提前发放经济赔偿金，并在辞退时补缴少给的部分，这一做法是否合法，需分情况讨论：
若公司提前发放经济赔偿金的行为符合法律规定，且后续补缴行为也合法合规：
- 在某些情况下，公司可能因经营策略调整、人员优化等原因，提前与员工协商解除劳动合同，并依法支付经济赔偿金。如果公司提前发放的经济赔偿金数额符合《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条规定的计算标准（即按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿），且后续补缴行为也是基于合法的原因（如之前计算有误或遗漏），则这一做法是合法的。
若公司提前发放经济赔偿金的行为不符合法律规定，或后续补缴行为存在违法情形：
- 如果公司提前发放的经济赔偿金数额低于法定标准，或者是在没有合法解除劳动合同的情况下擅自发放的“赔偿金”（实际上可能构成违法解除劳动合同的赔偿金预付），则这一行为可能违法。此外，如果后续补缴行为并非基于合法原因，而是公司为了规避法律责任或掩盖之前的违法行为而进行的，那么这一补缴行为也是不合法的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十八条和第八十七条，用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同的，应当依照本法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。如果公司提前发放的经济赔偿金低于这一标准，或者是在违法解除劳动合同的情况下发放的，那么劳动者有权要求公司按照法定标准支付赔偿金。
针对您的情况，我有以下几点建议：
- 核实经济赔偿金的计算标准：首先，您需要核实公司提前发放的经济赔偿金是否按照《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条规定的标准进行了计算。如果计算有误或低于法定标准，您有权要求公司补足差额。
- 保留相关证据：无论公司是否提前发放了经济赔偿金，您都需要保留好与劳动合同解除相关的所有证据，包括但不限于劳动合同、工资条、解除或终止劳动合同的证明、公司提前发放经济赔偿金的凭证等。这些证据将在您后续维护自己权益时发挥重要作用。
- 与公司协商或申请劳动仲裁：如果您发现公司提前发放的经济赔偿金存在违法情形，或者后续补缴行为不符合法律规定，您可以先尝试与公司进行协商，要求公司按照法定标准支付赔偿金。如果协商不成，您可以向用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求公司支付拖欠的赔偿金或经济补偿。
最后需要强调的是，劳动法律关系复杂且多变，每个具体案件的情况都可能有所不同。因此，在处理类似问题时，建议您根据自己的实际情况和具体证据来进行分析和判断。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。