总公司签订的合同由分公司履行，在符合相关法律法规和合同约定的情况下，是合法的。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律地位与授权

分公司作为总公司的分支机构，不具有独立的法人资格，其民事责任最终由总公司承担。然而，分公司可以在总公司的授权范围内从事经营活动，包括以自己的名义对外签订合同和开展业务。这意味着，总公司签订的合同，在获得总公司明确授权的情况下，可以由分公司来履行。这种授权可以通过内部的授权文件、合同中的明确条款或其他书面形式来实现。

二、合同约定与交易习惯

1. 合同约定：合同中应明确约定分公司可以作为合同履行主体，或者至少不禁止分公司代为履行。如果合同明确规定必须由总公司亲自履行，那么分公司不能代替履行，否则可能构成违约。因此，在签订合同时，双方应明确约定分公司的履行角色和权限。

2. 交易习惯：在长期商业合作中，如果存在总公司签订合同、分公司实际履行的交易习惯，并且双方均无异议，那么这种履行方式也通常被认为是合法的。但需要注意的是，交易习惯不能违背法律的强制性规定。

三、非法履行的情形与法律责任

1. 非法履行的情形：
   • 未经合同相对方的同意，总公司擅自将合同义务转给分公司履行。
   • 分公司超越总公司的授权范围与合同相对方签订合同或履行合同义务。

这些行为可能构成违约或无效行为，需要承担相应的法律责任。

1. 法律责任：
   • 在分公司履行合同的过程中，如果发生违约或其他法律纠纷，总公司通常是法律责任主体。
   • 分公司作为总公司的附属机构，首先用其自身资金承担赔偿责任，不足部分则由总公司承担。

四、实际操作建议

1. 明确授权：总公司在签订合同时，应明确授权分公司履行合同，并通过书面形式记录下来。同时，合同相对方应对此知悉并同意。

2. 合同条款：在合同中明确约定分公司的履行角色和权限，以及违约责任和争议解决方式等条款。

3. 信息披露：总公司有义务将分公司履行合同的情况及时、明确地告知合同相对方，以避免因信息不对称而引发的纠纷。

4. 法律审查：在签订合同前，建议双方进行法律审查，确保合同内容合法合规，避免潜在的法律风险。

举例说明：假设一家总公司与一家供应商签订了采购合同，约定由总公司采购一批货物。后来，由于总公司业务调整，决定由其分公司实际履行该合同。在这种情况下，如果总公司明确授权分公司履行合同，并且供应商对此知悉并同意，那么这种履行方式就是合法的。反之，如果总公司未经供应商同意擅自将合同义务转给分公司履行，就可能构成违约。

如果您在总公司签订合同由分公司履行的过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。