关于收公司货款抵扣报销款是否合法的问题，这并非一个简单的“是”或“否”可以回答，它取决于多种因素和具体情境。以下是我从不同角度为你进行的分析：

1. 合同与协议的角度

• 如果公司与客户或供应商之间有明确的合同或协议，规定了货款与报销款之间的抵扣方式或条件，那么按照合同或协议的约定进行抵扣是合法的。这种情况下，抵扣行为是基于双方自愿和平等协商的原则进行的。
• 如果合同或协议中没有相关规定，或者规定不明确，那么单方面进行货款与报销款的抵扣可能构成违约行为，需要承担相应的法律责任。

2. 公司内部规章制度的角度

• 如果公司内部有明确的规章制度，规定了货款与报销款的处理流程和抵扣规则，且这些规章制度不违反法律法规的强制性规定，那么按照公司内部规章制度进行抵扣是合法的。
• 如果公司内部规章制度没有相关规定，或者规定与法律法规相冲突，那么这种抵扣行为可能面临法律风险。

3. 法律法规的角度

• 从一般的法律法规来看，货款与报销款是两种不同性质的款项，它们之间并没有直接的抵扣关系。除非有明确的法律依据或合同约定，否则单方面进行抵扣可能构成不当得利或违反财务规定。
• 特定情况下，如果货款与报销款之间存在某种法律上的关联（如因同一交易产生的费用），且符合相关法律法规的规定，那么进行抵扣可能是合法的。但这种情况较为特殊，需要具体分析。

4. 实际操作中的建议

• 在进行货款与报销款的抵扣前，建议先审查相关的合同、协议和公司内部规章制度，确保抵扣行为有明确的依据。
• 如果无法确定抵扣行为的合法性，或者存在争议，建议咨询专业的法律人士或财务顾问，以避免潜在的法律风险。
• 在实际操作中，应确保抵扣行为的透明度和公正性，避免因操作不当而引发的纠纷。

总结来看，收公司货款抵扣报销款是否合法，取决于合同与协议的约定、公司内部规章制度的规定以及相关法律法规的适用。在没有明确依据的情况下，单方面进行抵扣可能面临法律风险。因此，在进行此类操作时，务必谨慎行事，并咨询专业的法律人士或财务顾问的意见。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。