针对您提出的问题，即“父亲以儿子公司进行民间借贷后父亲死亡，法院该怎么判”，我们可以从以下几个方面进行深入分析和解答：
借贷关系的认定：
- 首先，需要明确的是，父亲以儿子公司的名义进行民间借贷，这一行为本身是否构成有效的借贷关系，关键在于是否得到了儿子公司的授权或事后追认。如果父亲在借贷时并未获得儿子公司的明确授权，且事后儿子公司也未进行追认，那么这一借贷行为可能仅被视为父亲的个人行为，而非儿子公司的行为。
- 法院在审理此类案件时，会重点审查借贷合同的签订过程、资金流向、以及儿子公司是否知晓并同意该借贷行为等因素，以确定借贷关系的真实性和有效性。
父亲死亡后的债务处理：
- 当父亲死亡后，其生前所负的债务（包括本案中的民间借贷债务）原则上应由其遗产来清偿。如果父亲的遗产不足以清偿全部债务，那么债权人（即出借人）可能只能按照遗产的实际价值来获得清偿。
- 需要注意的是，如果父亲在借贷时存在恶意转移财产、逃避债务等行为，或者儿子公司实际参与了借贷并从中受益，那么债权人可能还有权向儿子公司或其他相关责任人追偿。
法院的判决依据：
- 法院在判决此类案件时，会依据《中华人民共和国民法典》中关于借贷合同、遗产继承等相关法律法规的规定，结合案件的具体事实和证据，进行综合判断。
- 如果法院认定借贷关系成立且有效，且父亲的遗产不足以清偿全部债务，那么法院可能会判决由父亲的遗产继承人在继承遗产的范围内承担清偿责任。如果儿子公司被认定为实际借款人或受益人，那么法院也可能判决儿子公司承担相应的清偿责任。
综上所述，法院在判决此类案件时，会综合考虑借贷关系的真实性、有效性，以及父亲死亡后的债务处理和遗产继承等因素。如果您或您的家人面临类似的法律问题，建议直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细、更专业的法律建议。