针对您提出的“仅约定由仲裁机构仲裁，是否能仲裁”的问题，我的分析如下：

1. 仅约定由仲裁机构仲裁，仲裁协议的有效性需结合具体情况判断

• 有效情况：如果双方在合同或其他法律文件中明确约定了由某一具体的仲裁机构进行仲裁，并且该约定符合法律的形式与实质要件（如双方具有完全民事行为能力、意思表示真实、不违反法律法规的强制性规定等），那么这样的仲裁协议通常是有效的。

• 无效情况：然而，如果仅约定了“由仲裁机构仲裁”而未明确具体的仲裁机构，且事后双方无法就仲裁机构的选择达成一致，那么这样的仲裁协议可能被视为无效。因为根据《仲裁法》及相关司法解释，仲裁协议应当明确选定仲裁委员会，否则仲裁无法进行。

2. 仲裁协议无效的法律后果

• 如果仲裁协议被认定无效，那么当事人之间的争议将无法通过仲裁方式解决，而需要寻求其他途径，如向法院提起诉讼。

3. 实际操作建议

• 明确仲裁机构：为了避免仲裁协议被认定无效，双方在签订合同时应当明确约定具体的仲裁机构。

• 审查仲裁协议：在签订合同前，双方应当仔细审查仲裁协议的内容，确保其符合法律法规的要求，并且双方对仲裁协议的内容有清晰、一致的理解。

• 咨询专业律师：如果对仲裁协议的有效性存在疑问，或者不确定如何签订有效的仲裁协议，建议咨询专业律师以获取法律意见。

综上所述，仅约定由仲裁机构仲裁，并不能直接确定仲裁协议的有效性。仲裁协议的有效性需要结合具体情况进行判断，包括双方的意思表示、仲裁机构的明确性、法律法规的要求等因素。如果您在签订合同或处理争议时遇到相关问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见。