针对您被公司强制排长休假两年且目前仍在职的情况，是否可以申请劳动仲裁，我的分析如下：

1. 判断公司强制休假是否合理：

   • 首先，需要审视公司强制您休假的理由是否合法合规。若公司因生产经营困难，依照相关法律法规和劳动合同约定安排停工休假，并支付了相应的工资待遇，那么您申请劳动仲裁可能难以获得支持。
   • 然而，若公司无正当理由强制您休假，且未支付或低于法定标准支付工资，这明显损害了您的合法权益，您完全有权申请劳动仲裁。

2. 若申请仲裁，您的诉求：

   • 在申请劳动仲裁时，您可以要求公司按照正常工资标准支付您休假期间的工资，或者要求公司恢复您正常的工作状态。

3. 申请仲裁时需准备的证据：

   • 为了支持您的仲裁请求，您需要准备好劳动合同、工资支付记录、考勤记录等关键证据，以证明公司的不当行为和您的合法权益受损情况。

4. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条的规定，中华人民共和国境内的用人单位与劳动者之间因劳动报酬等发生的争议，均适用本法。公司强制休假且不支付或低支付工资，显然属于劳动报酬争议的范畴，您有权据此申请劳动仲裁。

综上所述：

• 若公司强制您休假的理由合法合规，且已支付相应工资，您申请仲裁可能难以成功。
• 但若公司无正当理由强制您休假，且未支付或低支付工资，您完全有权申请劳动仲裁，并要求公司承担相应的法律责任。

建议您：

• 在决定申请劳动仲裁前，先与公司进行沟通协商，看是否能通过友好方式解决问题。
• 若协商无果，再考虑申请劳动仲裁，并确保准备好充分的证据以支持您的诉求。

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