针对您提出的问题，即在线下卖电脑实体店7天内退款后，因零件包装盒缺失商家要扣您2000元是否合理，我的分析如下：

1. 从消费者权益保护的角度来看：

   • 根据《中华人民共和国消费者权益保护法》的相关规定，消费者在购买商品后享有七日无理由退货的权利（部分特殊商品除外）。在此期限内，消费者有权要求退货，且商家应当无条件接受，除非商品存在因消费者使用或保管不当造成的损坏。
   • 在您的情况下，如果电脑本身没有损坏，仅是零件的包装盒缺失，这通常不被视为影响商品二次销售的严重缺陷。因此，商家以此为由扣除您2000元可能并不合理。

2. 从合同约定的角度来看：

   • 如果您在购买电脑时与商家签订了书面合同，且合同中明确规定了关于退货、退款以及包装盒缺失的处理方式，那么您应当遵守合同约定。
   • 然而，如果合同中没有明确规定包装盒缺失需要扣除如此高额的费用，或者该规定显失公平（例如，扣除的费用远高于包装盒的实际价值），那么您有权对商家的这一要求提出异议。

3. 从实际损失的角度来看：

   • 商家扣除您2000元的依据应当是其因包装盒缺失而遭受的实际损失。如果包装盒的价值远低于2000元，或者商家无法证明其因包装盒缺失而遭受了如此高额的损失，那么商家的这一要求显然是不合理的。

建议：

• 首先，您可以与商家进行友好协商，说明您的立场和理由，尝试达成一个双方都能接受的解决方案。
• 如果协商无果，您可以向当地的消费者协会或市场监管部门投诉，寻求他们的帮助和支持。
• 在必要时，您也可以考虑通过法律途径来维护自己的合法权益，比如向法院提起诉讼。

总结：商家因零件包装盒缺失而扣除您2000元的要求，在大多数情况下可能是不合理的。您有权根据自己的实际情况和法律规定，对商家的这一要求提出异议，并寻求相应的法律救济。如果您有任何进一步的法律问题或需要更具体的建议，请随时向我咨询。