针对您提出的“实际工作的公司与劳动合同上的不一样，该如何维权”的问题，以下是我的详细解答：
一、合法情形与风险分析
合法情形：
- 劳务派遣：在劳务派遣模式下，劳动者与劳务派遣单位签订劳动合同，随后被派遣到实际用工单位工作。这种模式下，劳动合同上的公司与实际工作公司不一致是合法的，但需确保双方依法操作，并签订明确的劳务派遣协议。
- 借调：借调模式下，原用人单位与借调单位协商，将劳动者借调至借调单位工作一段时间，劳动者与原用人单位的劳动合同关系依然存续。只要三方协商一致，并签订借调协议，这种不一致也是受法律认可的。
可能存在的风险：
- 主体责任不明确：在涉及劳动者权益保护时，若两公司间约定不明，可能导致责任推诿，使劳动者维权困难。
- 劳动者权益受损：由于实际工作公司并非劳动合同主体，劳动者可能无法享受与实际工作公司正式员工同等的待遇和福利。
二、维权建议
了解法律关系：
- 劳动者应首先了解自己与劳动合同上的公司以及实际工作公司之间的法律关系，明确自己的权益和义务。
收集证据：
- 劳动者应收集与劳动合同、实际工作情况相关的所有证据，包括但不限于劳动合同、工资单、社保缴纳记录、工作牌、工作邮件等，以备维权之需。
与新公司协商：
- 劳动者可以尝试与实际工作公司协商，要求调整劳动合同或签订补充协议，明确双方的权利义务和责任。
寻求劳动仲裁或提起劳动诉讼：
- 若协商无果，劳动者可以向劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求确认劳动关系、支付未发放的工资、违法解除劳动关系赔偿金以及应休未休的年休假工资等。若对仲裁结果不服，还可以向人民法院提起诉讼。
三、具体案例参考
以李某的案例为例，李某在运输车队工作，但劳动合同是与某商贸公司签署的，且由某商贸公司为其购买社保。在发生劳动争议时，区人民法院认定运输车队和某商贸公司存在混同用工的行为，应当依法承担连带责任。最终，法院判决商贸公司支付李某应休未休年休假的工资差额，运输车队承担连带清偿责任。
四、注意事项
- 劳动者在维权过程中应保持冷静和理性，避免采取过激行为。
- 劳动者应充分了解自己的权益和义务，以及维权途径和程序。
- 如有需要，劳动者可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议和帮助。
综上所述，当实际工作的公司与劳动合同上的不一样时，劳动者应首先了解法律关系，收集证据，并尝试与新公司协商。若协商无果，可以通过劳动仲裁或提起劳动诉讼来维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。