公积金基数低于平均工资是否合法，需根据具体情况判断，但一般情况下，公积金基数应不低于当地最低工资标准，且应尽可能与职工实际工资水平相符。以下是对此问题的详细分析：

1. 公积金缴存基数的确定原则：

   • 根据《住房公积金管理条例》的相关规定，职工住房公积金的月缴存额应为职工本人上一年度月平均工资乘以职工住房公积金缴存比例。这意味着，公积金的缴存基数原则上应与职工的实际工资水平一致。
   • 住房公积金缴存基数不得低于市人力资源和社会保障部门公布的上一年度职工月最低工资标准，这是公积金缴存基数的下限。

2. 公积金基数低于平均工资的情况分析：

   • 如果公积金基数低于职工的实际平均工资，但高于当地最低工资标准，这可能并不直接违法，但可能不符合公积金缴存的原则和目的，即确保职工有足够的住房保障。
   • 如果公积金基数低于当地最低工资标准，那么这显然是违法的，因为违反了公积金缴存基数的下限规定。

3. 公积金基数与平均工资关系的法律考量：

   • 公积金缴存基数应尽可能反映职工的实际工资水平，以确保公积金制度的公平性和有效性。如果公积金基数长期低于平均工资，可能导致职工在购房、租房等住房需求上得不到足够的支持。
   • 单位在设定公积金缴存基数时，应遵守相关法律法规，确保公积金缴存的合法性和合规性。如果单位故意将公积金基数设定低于平均工资以规避法律责任或谋取不当利益，将受到法律的制裁。

4. 职工应对措施：

   • 职工在发现公积金基数存在疑问或不合规情况时，应积极向当地住房公积金管理中心咨询和反映情况。
   • 职工有权要求单位按照实际工资水平调整公积金缴存基数，并确保公积金缴存的合法性和合规性。如果单位拒绝调整或存在其他违规行为，职工可以向相关部门投诉或寻求法律援助。

综上所述，公积金基数低于平均工资是否合法需根据具体情况判断。但一般情况下，公积金基数应不低于当地最低工资标准，且应尽可能与职工实际工资水平相符。职工在发现公积金基数存在问题时，应积极采取措施维护自己的合法权益。如有任何法律问题或疑问，欢迎直接向我咨询。