您好，关于您提出的“同一单位公积金缴存基数不同是否合法”的问题，我进行了详细的了解和分析，以下是我的解答：

首先，我们需要明确的是，公积金缴存基数与缴存比例是两个不同的概念。缴存基数通常是根据职工的月平均工资来确定的，而缴存比例则是单位按照一定规定为职工缴存公积金的比例。您所提到的“缴存基数不同”，我理解为在同一单位内，不同职工的公积金缴存基数存在差异。

对于这一问题，根据《住房公积金管理条例》及相关规定，单位为职工缴存住房公积金时，原则上应基于职工的月平均工资来确定缴存基数，并且这个基数对于单位内的所有职工应当是统一的。然而，在实际操作中，由于职工的工资水平可能存在差异，因此不同职工的公积金缴存基数也可能相应不同。这种基于职工实际工资水平的差异而导致的缴存基数不同，是符合规定的。

但是，如果单位在确定公积金缴存基数时，不是基于职工的实际工资水平，而是随意设定不同的基数，或者对同一岗位、相同工资水平的职工设定不同的缴存基数，那么这种做法就可能违反公平性和一致性的原则，也可能违反相关法律法规的规定。

综上所述，同一单位内公积金缴存基数不同，如果这种差异是基于职工实际工资水平的合理差异，并且是符合相关规定和程序的，那么它是合法的。但如果这种差异是随意设定的，或者违反了相关规定和程序，那么它就是不合法的。因此，在具体情况下，我们需要根据实际情况和相关规定来判断。

希望这个解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。